Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 PRG2-204ENST00000533605 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.515e-83■■■■■ 52.2
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SND1Q7KZF4 CTSC-208ENST00000533897 4344 ntTSL 24.87□□□□□ -1.631e-12■■■■■ 52
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SND1Q7KZF4 A1BG-203ENST00000596924 2134 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.731e-13■■■■■ 51.3
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SND1Q7KZF4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 51.2
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SND1Q7KZF4 NRM-207ENST00000474864 1029 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -02e-8■■■■■ 51.2
SND1Q7KZF4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 51.2
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SND1Q7KZF4 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-16■■■■■ 50.6
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SND1Q7KZF4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 48.8
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SND1Q7KZF4 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.79e-8■■■■■ 48.4
SND1Q7KZF4 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.739e-8■■■■■ 48.4
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SND1Q7KZF4 ATP1B3-208ENST00000486782 229 ntTSL 27.29□□□□□ -1.243e-11■■■■■ 48.2
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SND1Q7KZF4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.64e-8■■■■■ 48.1
SND1Q7KZF4 RABAC1-204ENST00000598057 662 nt18.68■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 48.1
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SND1Q7KZF4 RABAC1-206ENST00000600292 653 ntTSL 217.92■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 48.1
SND1Q7KZF4 RABAC1-207ENST00000601028 530 ntTSL 215.84■□□□□ 0.134e-8■■■■■ 48.1
SND1Q7KZF4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-7■■■■■ 48
SND1Q7KZF4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 48
SND1Q7KZF4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 48
SND1Q7KZF4 MSMO1-205ENST00000507013 973 ntTSL 222.1■■□□□ 1.138e-11■■■■■ 48
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SND1Q7KZF4 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 417.62■□□□□ 0.417e-28■■■■■ 47.9
SND1Q7KZF4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.591e-7■■■■■ 47.8
SND1Q7KZF4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 47.8
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SND1Q7KZF4 SH3BP1-202ENST00000417536 2858 ntTSL 220.66■□□□□ 0.94e-13■■■■■ 47.6
SND1Q7KZF4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.884e-13■■■■■ 47.6
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SND1Q7KZF4 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 214.21□□□□□ -0.144e-13■■■■■ 47.6
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