RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507013.5

MSMO1-205, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

TSL 2

Gene MSMO1, Length 973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-205ENST00000507013 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.75■■■■■ 6.03
MSMO1-205ENST00000507013 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.01■■■■■ 5.12
MSMO1-205ENST00000507013 ABCC9O60706 1549 aa46.3■■■■■ 5
MSMO1-205ENST00000507013 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.39■■■■■ 4.7
MSMO1-205ENST00000507013 NACADO15069 1562 aa44.27■■■■■ 4.68
MSMO1-205ENST00000507013 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.15■■■■■ 4.66
MSMO1-205ENST00000507013 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.92■■■■■ 4.62
MSMO1-205ENST00000507013 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
MSMO1-205ENST00000507013 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.62■■■■■ 4.57
MSMO1-205ENST00000507013 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.48■■■■■ 4.55
MSMO1-205ENST00000507013 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.24■■■■■ 4.51
MSMO1-205ENST00000507013 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.14■■■■■ 4.5
MSMO1-205ENST00000507013 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.9■■■■■ 4.46
MSMO1-205ENST00000507013 SCRIBQ14160 1630 aa42.86■■■■■ 4.45
MSMO1-205ENST00000507013 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.55■■■■■ 4.4
MSMO1-205ENST00000507013 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
MSMO1-205ENST00000507013 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.89■■■■■ 4.3
MSMO1-205ENST00000507013 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.64■■■■■ 4.26
MSMO1-205ENST00000507013 SMARCA4P51532 1647 aa40.98■■■■■ 4.15
MSMO1-205ENST00000507013 NCAPD3P42695 1498 aa40.89■■■■■ 4.14
MSMO1-205ENST00000507013 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
MSMO1-205ENST00000507013 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.85■■■■■ 4.13
MSMO1-205ENST00000507013 SMARCA2P51531 1590 aa40.75■■■■■ 4.11
MSMO1-205ENST00000507013 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.65■■■■■ 4.1
MSMO1-205ENST00000507013 HMGXB3Q12766 1538 aa40.62■■■■■ 4.09
MSMO1-205ENST00000507013 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.61■■■■■ 4.09
MSMO1-205ENST00000507013 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
MSMO1-205ENST00000507013 WIZO95785 1651 aa40.21■■■■■ 4.03
MSMO1-205ENST00000507013 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
MSMO1-205ENST00000507013 NESP48681 1621 aa40.01■■■■■ 4
MSMO1-205ENST00000507013 ERCC6Q03468 1493 aa39.88■■■■□ 3.98
MSMO1-205ENST00000507013 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.82■■■■□ 3.97
MSMO1-205ENST00000507013 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
MSMO1-205ENST00000507013 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.66■■■■□ 3.94
MSMO1-205ENST00000507013 CUX2O14529 1486 aa39.61■■■■□ 3.93
MSMO1-205ENST00000507013 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.55■■■■□ 3.92
MSMO1-205ENST00000507013 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.53■■■■□ 3.92
MSMO1-205ENST00000507013 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
MSMO1-205ENST00000507013 CFTRP13569 1480 aa39.37■■■■□ 3.89
MSMO1-205ENST00000507013 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.29■■■■□ 3.88
MSMO1-205ENST00000507013 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.18■■■■□ 3.86
MSMO1-205ENST00000507013 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.17■■■■□ 3.86
MSMO1-205ENST00000507013 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.14■■■■□ 3.86
MSMO1-205ENST00000507013 WDR62O43379 1518 aa39.07■■■■□ 3.84
MSMO1-205ENST00000507013 PRDM2Q13029 1718 aa39.05■■■■□ 3.84
MSMO1-205ENST00000507013 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
MSMO1-205ENST00000507013 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.85■■■■□ 3.81
MSMO1-205ENST00000507013 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
MSMO1-205ENST00000507013 TOPBP1Q92547 1522 aa38.54■■■■□ 3.76
MSMO1-205ENST00000507013 ABCC8Q09428 1581 aa38.49■■■■□ 3.75
MSMO1-205ENST00000507013 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.45■■■■□ 3.75
MSMO1-205ENST00000507013 IFT140Q96RY7 1462 aa38.35■■■■□ 3.73
MSMO1-205ENST00000507013 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
MSMO1-205ENST00000507013 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
MSMO1-205ENST00000507013 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
MSMO1-205ENST00000507013 CUX1P39880 1505 aa38.15■■■■□ 3.7
MSMO1-205ENST00000507013 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
MSMO1-205ENST00000507013 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.04■■■■□ 3.68
MSMO1-205ENST00000507013 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
MSMO1-205ENST00000507013 SOGA1O94964 1423 aa38.03■■■■□ 3.68
MSMO1-205ENST00000507013 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.99■■■■□ 3.672e-7■■■■□ 23.9
MSMO1-205ENST00000507013 OSCARQ8IYS5 282 aa37.94■■■■□ 3.66
MSMO1-205ENST00000507013 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
MSMO1-205ENST00000507013 WDR97A6NE52 1622 aa37.79■■■■□ 3.64
MSMO1-205ENST00000507013 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.74■■■■□ 3.63
MSMO1-205ENST00000507013 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.73■■■■□ 3.63
MSMO1-205ENST00000507013 TOP2BQ02880 1626 aa37.72■■■■□ 3.63
MSMO1-205ENST00000507013 SYNJ1O43426 1573 aa37.71■■■■□ 3.63
MSMO1-205ENST00000507013 CHD1O14646 1710 aa37.67■■■■□ 3.62
MSMO1-205ENST00000507013 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.66■■■■□ 3.62
MSMO1-205ENST00000507013 GRIN2BQ13224 1484 aa37.6■■■■□ 3.61
MSMO1-205ENST00000507013 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.59■■■■□ 3.61
MSMO1-205ENST00000507013 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.57■■■■□ 3.6
MSMO1-205ENST00000507013 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.55■■■■□ 3.6
MSMO1-205ENST00000507013 FBLN2P98095 1184 aa37.55■■■■□ 3.6
MSMO1-205ENST00000507013 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
MSMO1-205ENST00000507013 PBRM1Q86U86 1689 aa37.53■■■■□ 3.6
MSMO1-205ENST00000507013 SYNJ2O15056 1496 aa37.4■■■■□ 3.58
MSMO1-205ENST00000507013 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
MSMO1-205ENST00000507013 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
MSMO1-205ENST00000507013 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
MSMO1-205ENST00000507013 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.38■■■■□ 3.57
MSMO1-205ENST00000507013 TRIM41Q8WV44 630 aa37.36■■■■□ 3.57
MSMO1-205ENST00000507013 ARHGEF11O15085 1522 aa37.31■■■■□ 3.56
MSMO1-205ENST00000507013 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.25■■■■□ 3.55
MSMO1-205ENST00000507013 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.2■■■■□ 3.55
MSMO1-205ENST00000507013 ADAMTS12P58397 1594 aa37.19■■■■□ 3.54
MSMO1-205ENST00000507013 GRIN2AQ12879 1464 aa37.12■■■■□ 3.53
MSMO1-205ENST00000507013 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.11■■■■□ 3.53
MSMO1-205ENST00000507013 ARAP1Q96P48 1450 aa37.01■■■■□ 3.51
MSMO1-205ENST00000507013 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37■■■■□ 3.51
MSMO1-205ENST00000507013 NUP160Q12769 1436 aa36.99■■■■□ 3.51
MSMO1-205ENST00000507013 CEP170Q5SW79 1584 aa36.98■■■■□ 3.51
MSMO1-205ENST00000507013 KIF27Q86VH2 1401 aa36.96■■■■□ 3.51
MSMO1-205ENST00000507013 IGF1RP08069 1367 aa36.93■■■■□ 3.5
MSMO1-205ENST00000507013 CUL7Q14999 1698 aa36.79■■■■□ 3.48
MSMO1-205ENST00000507013 SHROOM2Q13796 1616 aa36.77■■■■□ 3.48
MSMO1-205ENST00000507013 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.74■■■■□ 3.47
MSMO1-205ENST00000507013 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.66■■■■□ 3.46
MSMO1-205ENST00000507013 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.65■■■■□ 3.46
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