Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLE2P56282 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLE2P56282 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLE2P56282 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLE2P56282 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLE2P56282 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLE2P56282 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLE2P56282 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLE2P56282 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLE2P56282 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLE2P56282 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLE2P56282 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLE2P56282 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLE2P56282 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLE2P56282 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLE2P56282 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLE2P56282 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLE2P56282 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLE2P56282 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLE2P56282 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLE2P56282 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLE2P56282 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLE2P56282 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLE2P56282 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLE2P56282 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLE2P56282 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLE2P56282 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLE2P56282 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLE2P56282 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLE2P56282 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLE2P56282 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLE2P56282 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLE2P56282 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLE2P56282 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLE2P56282 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLE2P56282 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLE2P56282 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLE2P56282 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLE2P56282 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLE2P56282 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLE2P56282 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLE2P56282 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLE2P56282 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLE2P56282 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLE2P56282 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLE2P56282 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLE2P56282 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POLE2P56282 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLE2P56282 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLE2P56282 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLE2P56282 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLE2P56282 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POLE2P56282 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLE2P56282 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLE2P56282 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLE2P56282 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLE2P56282 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
POLE2P56282 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLE2P56282 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLE2P56282 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLE2P56282 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLE2P56282 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLE2P56282 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLE2P56282 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLE2P56282 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLE2P56282 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLE2P56282 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLE2P56282 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLE2P56282 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLE2P56282 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLE2P56282 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLE2P56282 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLE2P56282 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLE2P56282 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLE2P56282 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLE2P56282 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLE2P56282 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLE2P56282 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLE2P56282 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLE2P56282 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLE2P56282 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLE2P56282 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLE2P56282 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLE2P56282 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLE2P56282 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLE2P56282 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLE2P56282 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLE2P56282 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLE2P56282 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLE2P56282 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLE2P56282 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLE2P56282 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLE2P56282 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLE2P56282 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
POLE2P56282 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLE2P56282 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLE2P56282 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLE2P56282 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLE2P56282 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLE2P56282 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms