RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532063.5

ILK-212, Transcript of integrin linked kinase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILK, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILK-212ENST00000532063 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.03■■■■■ 8.48
ILK-212ENST00000532063 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.52■■■■■ 7.12
ILK-212ENST00000532063 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.09■■■■■ 6.73
ILK-212ENST00000532063 ABCC9O60706 1549 aa56.41■■■■■ 6.62
ILK-212ENST00000532063 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.4■■■■■ 6.62
ILK-212ENST00000532063 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.19■■■■■ 6.59
ILK-212ENST00000532063 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.9■■■■■ 6.54
ILK-212ENST00000532063 NACADO15069 1562 aa55.57■■■■■ 6.49
ILK-212ENST00000532063 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.14■■■■■ 6.42
ILK-212ENST00000532063 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.05■■■■■ 6.4
ILK-212ENST00000532063 SCRIBQ14160 1630 aa54.51■■■■■ 6.32
ILK-212ENST00000532063 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.71■■■■■ 6.19
ILK-212ENST00000532063 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.3■■■■■ 6.12
ILK-212ENST00000532063 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.11■■■■■ 6.09
ILK-212ENST00000532063 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.9■■■■■ 6.06
ILK-212ENST00000532063 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.75■■■■■ 6.04
ILK-212ENST00000532063 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.62■■■■■ 6.01
ILK-212ENST00000532063 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.62■■■■■ 6.01
ILK-212ENST00000532063 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.45■■■■■ 5.99
ILK-212ENST00000532063 SMARCA4P51532 1647 aa52.32■■■■■ 5.97
ILK-212ENST00000532063 WIZO95785 1651 aa51.94■■■■■ 5.9
ILK-212ENST00000532063 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.8■■■■■ 5.88
ILK-212ENST00000532063 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.79■■■■■ 5.88
ILK-212ENST00000532063 SMARCA2P51531 1590 aa51.64■■■■■ 5.86
ILK-212ENST00000532063 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.59■■■■■ 5.85
ILK-212ENST00000532063 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.56■■■■■ 5.84
ILK-212ENST00000532063 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.31■■■■■ 5.8
ILK-212ENST00000532063 NCAPD3P42695 1498 aa51.27■■■■■ 5.8
ILK-212ENST00000532063 HMGXB3Q12766 1538 aa51.17■■■■■ 5.78
ILK-212ENST00000532063 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.07■■■■■ 5.77
ILK-212ENST00000532063 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.98■■■■■ 5.75
ILK-212ENST00000532063 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.53■■■■■ 5.68
ILK-212ENST00000532063 CFTRP13569 1480 aa50.01■■■■■ 5.6
ILK-212ENST00000532063 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.93■■■■■ 5.58
ILK-212ENST00000532063 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.92■■■■■ 5.58
ILK-212ENST00000532063 TRIM41Q8WV44 630 aa49.91■■■■■ 5.58
ILK-212ENST00000532063 ABCC8Q09428 1581 aa49.67■■■■■ 5.54
ILK-212ENST00000532063 PRDM2Q13029 1718 aa49.63■■■■■ 5.54
ILK-212ENST00000532063 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.6■■■■■ 5.53
ILK-212ENST00000532063 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.57■■■■■ 5.53
ILK-212ENST00000532063 NESP48681 1621 aa49.37■■■■■ 5.49
ILK-212ENST00000532063 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.32■■■■■ 5.49
ILK-212ENST00000532063 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.26■■■■■ 5.48
ILK-212ENST00000532063 SYNJ1O43426 1573 aa49.26■■■■■ 5.48
ILK-212ENST00000532063 TOP2BQ02880 1626 aa49.2■■■■■ 5.47
ILK-212ENST00000532063 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.13■■■■■ 5.45
ILK-212ENST00000532063 CUX1P39880 1505 aa49.08■■■■■ 5.45
ILK-212ENST00000532063 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.08■■■■■ 5.45
ILK-212ENST00000532063 EEA1Q15075 1411 aa48.87■■■■■ 5.41
ILK-212ENST00000532063 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.84■■■■■ 5.41
ILK-212ENST00000532063 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.79■■■■■ 5.4
ILK-212ENST00000532063 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.76■■■■■ 5.4
ILK-212ENST00000532063 SOGA1O94964 1423 aa48.74■■■■■ 5.39
ILK-212ENST00000532063 TOPBP1Q92547 1522 aa48.73■■■■■ 5.39
ILK-212ENST00000532063 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.65■■■■■ 5.38
ILK-212ENST00000532063 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.63■■■■■ 5.38
ILK-212ENST00000532063 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.57■■■■■ 5.37
ILK-212ENST00000532063 ERCC6Q03468 1493 aa48.53■■■■■ 5.36
ILK-212ENST00000532063 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.5■■■■■ 5.36
ILK-212ENST00000532063 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.49■■■■■ 5.35
ILK-212ENST00000532063 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
ILK-212ENST00000532063 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.45■■■■■ 5.35
ILK-212ENST00000532063 KIF27Q86VH2 1401 aa48.44■■■■■ 5.34
ILK-212ENST00000532063 WDR62O43379 1518 aa48.3■■■■■ 5.32
ILK-212ENST00000532063 CUX2O14529 1486 aa48.28■■■■■ 5.32
ILK-212ENST00000532063 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.27■■■■■ 5.32
ILK-212ENST00000532063 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.22■■■■■ 5.31
ILK-212ENST00000532063 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.3
ILK-212ENST00000532063 KIF21BO75037 1637 aa48.09■■■■■ 5.29
ILK-212ENST00000532063 GOLGA3Q08378 1498 aa48.06■■■■■ 5.28
ILK-212ENST00000532063 WDR97A6NE52 1622 aa48.01■■■■■ 5.28
ILK-212ENST00000532063 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.98■■■■■ 5.27
ILK-212ENST00000532063 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.98■■■■■ 5.27
ILK-212ENST00000532063 IFT140Q96RY7 1462 aa47.97■■■■■ 5.27
ILK-212ENST00000532063 PRXQ9BXM0 1461 aa47.96■■■■■ 5.27
ILK-212ENST00000532063 IGF1RP08069 1367 aa47.96■■■■■ 5.27
ILK-212ENST00000532063 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.89■■■■■ 5.26
ILK-212ENST00000532063 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.87■■■■■ 5.25
ILK-212ENST00000532063 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
ILK-212ENST00000532063 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.83■■■■■ 5.25
ILK-212ENST00000532063 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
ILK-212ENST00000532063 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.82■■■■■ 5.24
ILK-212ENST00000532063 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.79■■■■■ 5.24
ILK-212ENST00000532063 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.75■■■■■ 5.23
ILK-212ENST00000532063 CUL7Q14999 1698 aa47.65■■■■■ 5.22
ILK-212ENST00000532063 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.56■■■■■ 5.28e-7■■■■□ 23.1
ILK-212ENST00000532063 GRIN2BQ13224 1484 aa47.53■■■■■ 5.2
ILK-212ENST00000532063 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
ILK-212ENST00000532063 CEP162Q5TB80 1403 aa47.5■■■■■ 5.19
ILK-212ENST00000532063 PBRM1Q86U86 1689 aa47.43■■■■■ 5.18
ILK-212ENST00000532063 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
ILK-212ENST00000532063 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.34■■■■■ 5.17
ILK-212ENST00000532063 CLIP1P30622 1438 aa47.25■■■■■ 5.16
ILK-212ENST00000532063 ADAMTS12P58397 1594 aa47.24■■■■■ 5.15
ILK-212ENST00000532063 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.15
ILK-212ENST00000532063 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.15■■■■■ 5.14
ILK-212ENST00000532063 SYNJ2O15056 1496 aa46.97■■■■■ 5.11
ILK-212ENST00000532063 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.96■■■■■ 5.11
ILK-212ENST00000532063 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.95■■■■■ 5.11
ILK-212ENST00000532063 GRIN2AQ12879 1464 aa46.9■■■■■ 5.1
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