RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.89■■■■■ 8.3
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LMO2-202ENST00000395833 ABCC9O60706 1549 aa55.39■■■■■ 6.46
LMO2-202ENST00000395833 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.27■■■■■ 6.44
LMO2-202ENST00000395833 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.64■■■■■ 6.34
LMO2-202ENST00000395833 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.6■■■■■ 6.33
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LMO2-202ENST00000395833 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.78■■■■■ 5.72
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LMO2-202ENST00000395833 SMARCA2P51531 1590 aa50.62■■■■■ 5.69
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LMO2-202ENST00000395833 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.42■■■■■ 5.34
LMO2-202ENST00000395833 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.38■■■■■ 5.34
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LMO2-202ENST00000395833 ERCC6Q03468 1493 aa47.53■■■■■ 5.2
LMO2-202ENST00000395833 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.49■■■■■ 5.19
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LMO2-202ENST00000395833 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.4■■■■■ 5.18
LMO2-202ENST00000395833 WDR62O43379 1518 aa47.31■■■■■ 5.16
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LMO2-202ENST00000395833 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.23■■■■■ 5.15
LMO2-202ENST00000395833 PRXQ9BXM0 1461 aa47.23■■■■■ 5.15
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LMO2-202ENST00000395833 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.15■■■■■ 5.14
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LMO2-202ENST00000395833 CEP162Q5TB80 1403 aa47■■■■■ 5.11
LMO2-202ENST00000395833 IFT140Q96RY7 1462 aa46.99■■■■■ 5.11
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LMO2-202ENST00000395833 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
LMO2-202ENST00000395833 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.22■■■■■ 4.99
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