Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
COL5A1-AS1Q5SY13 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms