Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL5A1-AS1Q5SY13 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL5A1-AS1Q5SY13 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL5A1-AS1Q5SY13 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL5A1-AS1Q5SY13 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL5A1-AS1Q5SY13 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL5A1-AS1Q5SY13 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL5A1-AS1Q5SY13 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL5A1-AS1Q5SY13 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL5A1-AS1Q5SY13 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL5A1-AS1Q5SY13 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL5A1-AS1Q5SY13 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL5A1-AS1Q5SY13 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL5A1-AS1Q5SY13 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL5A1-AS1Q5SY13 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL5A1-AS1Q5SY13 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL5A1-AS1Q5SY13 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1-AS1Q5SY13 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL5A1-AS1Q5SY13 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL5A1-AS1Q5SY13 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL5A1-AS1Q5SY13 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL5A1-AS1Q5SY13 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL5A1-AS1Q5SY13 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL5A1-AS1Q5SY13 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL5A1-AS1Q5SY13 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL5A1-AS1Q5SY13 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL5A1-AS1Q5SY13 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COL5A1-AS1Q5SY13 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COL5A1-AS1Q5SY13 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COL5A1-AS1Q5SY13 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL5A1-AS1Q5SY13 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COL5A1-AS1Q5SY13 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL5A1-AS1Q5SY13 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL5A1-AS1Q5SY13 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL5A1-AS1Q5SY13 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL5A1-AS1Q5SY13 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL5A1-AS1Q5SY13 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL5A1-AS1Q5SY13 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL5A1-AS1Q5SY13 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL5A1-AS1Q5SY13 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL5A1-AS1Q5SY13 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL5A1-AS1Q5SY13 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL5A1-AS1Q5SY13 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL5A1-AS1Q5SY13 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL5A1-AS1Q5SY13 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL5A1-AS1Q5SY13 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL5A1-AS1Q5SY13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL5A1-AS1Q5SY13 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COL5A1-AS1Q5SY13 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COL5A1-AS1Q5SY13 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL5A1-AS1Q5SY13 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COL5A1-AS1Q5SY13 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms