Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAT1Q99536 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms