RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483906.5

RAB7A-204, Transcript of RAB7A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RAB7A, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7A-204ENST00000483906 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.56■■■■□ 3.92
RAB7A-204ENST00000483906 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.09■■■■□ 3.21
RAB7A-204ENST00000483906 ABCC9O60706 1549 aa34.25■■■■□ 3.07
RAB7A-204ENST00000483906 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.07■■■□□ 2.88
RAB7A-204ENST00000483906 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.99■■■□□ 2.87
RAB7A-204ENST00000483906 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
RAB7A-204ENST00000483906 NACADO15069 1562 aa32.97■■■□□ 2.87
RAB7A-204ENST00000483906 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.8■■■□□ 2.84
RAB7A-204ENST00000483906 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.72■■■□□ 2.83
RAB7A-204ENST00000483906 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.22■■■□□ 2.75
RAB7A-204ENST00000483906 SCRIBQ14160 1630 aa32.08■■■□□ 2.73
RAB7A-204ENST00000483906 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.05■■■□□ 2.72
RAB7A-204ENST00000483906 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.97■■■□□ 2.71
RAB7A-204ENST00000483906 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.64■■■□□ 2.66
RAB7A-204ENST00000483906 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.3■■■□□ 2.6
RAB7A-204ENST00000483906 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
RAB7A-204ENST00000483906 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.97■■■□□ 2.55
RAB7A-204ENST00000483906 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.81■■■□□ 2.52
RAB7A-204ENST00000483906 SMARCA4P51532 1647 aa30.67■■■□□ 2.5
RAB7A-204ENST00000483906 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
RAB7A-204ENST00000483906 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.5■■■□□ 2.47
RAB7A-204ENST00000483906 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.47■■■□□ 2.47
RAB7A-204ENST00000483906 SMARCA2P51531 1590 aa30.45■■■□□ 2.46
RAB7A-204ENST00000483906 NCAPD3P42695 1498 aa30.42■■■□□ 2.46
RAB7A-204ENST00000483906 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.34■■■□□ 2.45
RAB7A-204ENST00000483906 HMGXB3Q12766 1538 aa30.28■■■□□ 2.44
RAB7A-204ENST00000483906 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
RAB7A-204ENST00000483906 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
RAB7A-204ENST00000483906 WIZO95785 1651 aa30.17■■■□□ 2.42
RAB7A-204ENST00000483906 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
RAB7A-204ENST00000483906 NESP48681 1621 aa29.67■■■□□ 2.34
RAB7A-204ENST00000483906 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.6■■■□□ 2.33
RAB7A-204ENST00000483906 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
RAB7A-204ENST00000483906 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.56■■■□□ 2.32
RAB7A-204ENST00000483906 ERCC6Q03468 1493 aa29.54■■■□□ 2.32
RAB7A-204ENST00000483906 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.52■■■□□ 2.32
RAB7A-204ENST00000483906 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.43■■■□□ 2.3
RAB7A-204ENST00000483906 CFTRP13569 1480 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB7A-204ENST00000483906 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.31■■■□□ 2.28
RAB7A-204ENST00000483906 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.23■■■□□ 2.27
RAB7A-204ENST00000483906 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.19■■■□□ 2.26
RAB7A-204ENST00000483906 PRDM2Q13029 1718 aa29.18■■■□□ 2.26
RAB7A-204ENST00000483906 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
RAB7A-204ENST00000483906 CUX2O14529 1486 aa29.13■■■□□ 2.25
RAB7A-204ENST00000483906 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.1■■■□□ 2.25
RAB7A-204ENST00000483906 WDR62O43379 1518 aa28.99■■■□□ 2.23
RAB7A-204ENST00000483906 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
RAB7A-204ENST00000483906 ABCC8Q09428 1581 aa28.77■■■□□ 2.2
RAB7A-204ENST00000483906 TOPBP1Q92547 1522 aa28.77■■■□□ 2.2
RAB7A-204ENST00000483906 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.75■■■□□ 2.19
RAB7A-204ENST00000483906 CUX1P39880 1505 aa28.61■■■□□ 2.17
RAB7A-204ENST00000483906 IFT140Q96RY7 1462 aa28.56■■■□□ 2.16
RAB7A-204ENST00000483906 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
RAB7A-204ENST00000483906 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.49■■■□□ 2.15
RAB7A-204ENST00000483906 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
RAB7A-204ENST00000483906 SOGA1O94964 1423 aa28.43■■■□□ 2.14
RAB7A-204ENST00000483906 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
RAB7A-204ENST00000483906 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
RAB7A-204ENST00000483906 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.42■■■□□ 2.14
RAB7A-204ENST00000483906 SYNJ1O43426 1573 aa28.4■■■□□ 2.14
RAB7A-204ENST00000483906 TOP2BQ02880 1626 aa28.39■■■□□ 2.13
RAB7A-204ENST00000483906 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.38■■■□□ 2.13
RAB7A-204ENST00000483906 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
RAB7A-204ENST00000483906 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.128e-7■■■□□ 18.8
RAB7A-204ENST00000483906 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
RAB7A-204ENST00000483906 WDR97A6NE52 1622 aa28.22■■■□□ 2.11
RAB7A-204ENST00000483906 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.22■■■□□ 2.11
RAB7A-204ENST00000483906 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.11■■■□□ 2.09
RAB7A-204ENST00000483906 GRIN2BQ13224 1484 aa28.08■■■□□ 2.09
RAB7A-204ENST00000483906 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.08■■■□□ 2.09
RAB7A-204ENST00000483906 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.08■■■□□ 2.09
RAB7A-204ENST00000483906 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.04■■■□□ 2.08
RAB7A-204ENST00000483906 PBRM1Q86U86 1689 aa28.02■■■□□ 2.08
RAB7A-204ENST00000483906 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RAB7A-204ENST00000483906 FBLN2P98095 1184 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB7A-204ENST00000483906 OSCARQ8IYS5 282 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB7A-204ENST00000483906 TRIM41Q8WV44 630 aa27.94■■■□□ 2.06
RAB7A-204ENST00000483906 CHD1O14646 1710 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB7A-204ENST00000483906 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
RAB7A-204ENST00000483906 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB7A-204ENST00000483906 KIF27Q86VH2 1401 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB7A-204ENST00000483906 SYNJ2O15056 1496 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB7A-204ENST00000483906 ADAMTS12P58397 1594 aa27.82■■■□□ 2.04
RAB7A-204ENST00000483906 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.79■■■□□ 2.04
RAB7A-204ENST00000483906 IGF1RP08069 1367 aa27.74■■■□□ 2.03
RAB7A-204ENST00000483906 GRIN2AQ12879 1464 aa27.71■■■□□ 2.03
RAB7A-204ENST00000483906 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.67■■■□□ 2.02
RAB7A-204ENST00000483906 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.66■■■□□ 2.02
RAB7A-204ENST00000483906 CUL7Q14999 1698 aa27.65■■■□□ 2.02
RAB7A-204ENST00000483906 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.61■■■□□ 2.01
RAB7A-204ENST00000483906 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.6■■■□□ 2.01
RAB7A-204ENST00000483906 NUP160Q12769 1436 aa27.58■■■□□ 2
RAB7A-204ENST00000483906 CEP170Q5SW79 1584 aa27.56■■■□□ 2
RAB7A-204ENST00000483906 ARHGEF11O15085 1522 aa27.5■■□□□ 1.99
RAB7A-204ENST00000483906 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.49■■□□□ 1.99
RAB7A-204ENST00000483906 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.49■■□□□ 1.99
RAB7A-204ENST00000483906 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.49■■□□□ 1.99
RAB7A-204ENST00000483906 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.44■■□□□ 1.98
RAB7A-204ENST00000483906 EEA1Q15075 1411 aa27.43■■□□□ 1.98
RAB7A-204ENST00000483906 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.6 ms