Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
VAT1Q99536 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
VAT1Q99536 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
VAT1Q99536 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
VAT1Q99536 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VAT1Q99536 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
VAT1Q99536 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
VAT1Q99536 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VAT1Q99536 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VAT1Q99536 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
VAT1Q99536 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
VAT1Q99536 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
VAT1Q99536 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
VAT1Q99536 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
VAT1Q99536 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
VAT1Q99536 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
VAT1Q99536 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
VAT1Q99536 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
VAT1Q99536 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
VAT1Q99536 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
VAT1Q99536 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
VAT1Q99536 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
VAT1Q99536 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
VAT1Q99536 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
VAT1Q99536 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
VAT1Q99536 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
VAT1Q99536 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
VAT1Q99536 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
VAT1Q99536 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
VAT1Q99536 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
VAT1Q99536 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
VAT1Q99536 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VAT1Q99536 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
VAT1Q99536 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VAT1Q99536 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
VAT1Q99536 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VAT1Q99536 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
VAT1Q99536 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VAT1Q99536 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
VAT1Q99536 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VAT1Q99536 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
VAT1Q99536 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
VAT1Q99536 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VAT1Q99536 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
VAT1Q99536 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VAT1Q99536 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
VAT1Q99536 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
VAT1Q99536 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VAT1Q99536 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VAT1Q99536 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VAT1Q99536 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VAT1Q99536 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
VAT1Q99536 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
VAT1Q99536 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VAT1Q99536 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VAT1Q99536 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VAT1Q99536 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VAT1Q99536 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VAT1Q99536 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
VAT1Q99536 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAT1Q99536 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VAT1Q99536 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
VAT1Q99536 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VAT1Q99536 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VAT1Q99536 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VAT1Q99536 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VAT1Q99536 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VAT1Q99536 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VAT1Q99536 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
VAT1Q99536 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VAT1Q99536 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VAT1Q99536 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VAT1Q99536 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VAT1Q99536 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VAT1Q99536 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VAT1Q99536 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VAT1Q99536 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAT1Q99536 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VAT1Q99536 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VAT1Q99536 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VAT1Q99536 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VAT1Q99536 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VAT1Q99536 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAT1Q99536 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
VAT1Q99536 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VAT1Q99536 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAT1Q99536 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAT1Q99536 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAT1Q99536 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAT1Q99536 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAT1Q99536 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
VAT1Q99536 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
VAT1Q99536 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VAT1Q99536 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAT1Q99536 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAT1Q99536 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VAT1Q99536 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VAT1Q99536 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VAT1Q99536 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VAT1Q99536 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms