RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534506.5

AKIP1-211, Transcript of A-kinase interacting protein 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AKIP1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1-211ENST00000534506 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.52■■■■□ 3.76
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AKIP1-211ENST00000534506 MYO15BQ96JP2 1530 aa32■■■□□ 2.71
AKIP1-211ENST00000534506 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.98■■■□□ 2.71
AKIP1-211ENST00000534506 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.96■■■□□ 2.71
AKIP1-211ENST00000534506 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.92■■■□□ 2.7
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AKIP1-211ENST00000534506 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.01■■■□□ 2.56
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AKIP1-211ENST00000534506 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.78■■■□□ 2.36
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AKIP1-211ENST00000534506 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.63■■■□□ 2.33
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AKIP1-211ENST00000534506 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.54■■■□□ 2.32
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AKIP1-211ENST00000534506 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.5■■■□□ 2.15
AKIP1-211ENST00000534506 ERCC6Q03468 1493 aa28.4■■■□□ 2.14
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AKIP1-211ENST00000534506 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.31■■■□□ 2.12
AKIP1-211ENST00000534506 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.27■■■□□ 2.12
AKIP1-211ENST00000534506 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.21■■■□□ 2.11
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AKIP1-211ENST00000534506 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
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AKIP1-211ENST00000534506 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.68■■■□□ 2.02
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AKIP1-211ENST00000534506 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
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AKIP1-211ENST00000534506 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
AKIP1-211ENST00000534506 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.31■■□□□ 1.96
AKIP1-211ENST00000534506 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
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AKIP1-211ENST00000534506 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.27■■□□□ 1.96
AKIP1-211ENST00000534506 GRIN2BQ13224 1484 aa27.25■■□□□ 1.95
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AKIP1-211ENST00000534506 GRIN2AQ12879 1464 aa26.87■■□□□ 1.89
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AKIP1-211ENST00000534506 CHD1O14646 1710 aa26.87■■□□□ 1.89
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AKIP1-211ENST00000534506 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
AKIP1-211ENST00000534506 NUP160Q12769 1436 aa26.74■■□□□ 1.87
AKIP1-211ENST00000534506 CEP170Q5SW79 1584 aa26.66■■□□□ 1.86
AKIP1-211ENST00000534506 KIF21BO75037 1637 aa26.65■■□□□ 1.86
AKIP1-211ENST00000534506 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.65■■□□□ 1.86
AKIP1-211ENST00000534506 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.61■■□□□ 1.85
AKIP1-211ENST00000534506 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.58■■□□□ 1.85
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