RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629904.2

PKP4-AS1-203, PKP4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4-AS1, Length 1,951 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.87■■■■□ 3.33
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.09■■■□□ 2.57
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
PKP4-AS1-203ENST00000629904 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.72■■■□□ 2.35
PKP4-AS1-203ENST00000629904 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.59■■■□□ 2.33
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.56■■■□□ 2.32
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ABCC9O60706 1549 aa29.33■■■□□ 2.29
PKP4-AS1-203ENST00000629904 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.14■■■□□ 2.26
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NACADO15069 1562 aa28.94■■■□□ 2.22
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SCRIBQ14160 1630 aa28.73■■■□□ 2.19
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.64■■■□□ 2.18
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PKP4-AS1-203ENST00000629904 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.07■■■□□ 2.08
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.9■■■□□ 2.06
PKP4-AS1-203ENST00000629904 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.8■■■□□ 2.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
PKP4-AS1-203ENST00000629904 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.75■■■□□ 2.03
PKP4-AS1-203ENST00000629904 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
PKP4-AS1-203ENST00000629904 WIZO95785 1651 aa27.53■■■□□ 2
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SMARCA4P51532 1647 aa27.51■■□□□ 1.99
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.42■■□□□ 1.98
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.13■■□□□ 1.93
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.03■■□□□ 1.92
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.99■■□□□ 1.91
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SMARCA2P51531 1590 aa26.98■■□□□ 1.91
PKP4-AS1-203ENST00000629904 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PKP4-AS1-203ENST00000629904 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TRIM41Q8WV44 630 aa26.8■■□□□ 1.88
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NCAPD3P42695 1498 aa26.74■■□□□ 1.87
PKP4-AS1-203ENST00000629904 HMGXB3Q12766 1538 aa26.68■■□□□ 1.86
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ABCC8Q09428 1581 aa26.51■■□□□ 1.83
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.5■■□□□ 1.83
PKP4-AS1-203ENST00000629904 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.44■■□□□ 1.82
PKP4-AS1-203ENST00000629904 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PKP4-AS1-203ENST00000629904 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CFTRP13569 1480 aa26.21■■□□□ 1.79
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SYNJ1O43426 1573 aa26.17■■□□□ 1.78
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.1■■□□□ 1.77
PKP4-AS1-203ENST00000629904 SOGA1O94964 1423 aa26.09■■□□□ 1.77
PKP4-AS1-203ENST00000629904 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.05■■□□□ 1.76
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TOP2BQ02880 1626 aa26.02■■□□□ 1.76
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PRDM2Q13029 1718 aa26.01■■□□□ 1.76
PKP4-AS1-203ENST00000629904 EEA1Q15075 1411 aa26■■□□□ 1.75
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.97■■□□□ 1.75
PKP4-AS1-203ENST00000629904 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.96■■□□□ 1.75
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CUX1P39880 1505 aa25.92■■□□□ 1.74
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.91■■□□□ 1.74
PKP4-AS1-203ENST00000629904 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.88■■□□□ 1.73
PKP4-AS1-203ENST00000629904 NESP48681 1621 aa25.82■■□□□ 1.72
PKP4-AS1-203ENST00000629904 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.81■■□□□ 1.72
PKP4-AS1-203ENST00000629904 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.76■■□□□ 1.72
PKP4-AS1-203ENST00000629904 GOLGA3Q08378 1498 aa25.68■■□□□ 1.7
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.66■■□□□ 1.7
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.66■■□□□ 1.7
PKP4-AS1-203ENST00000629904 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PKP4-AS1-203ENST00000629904 KIF21BO75037 1637 aa25.64■■□□□ 1.7
PKP4-AS1-203ENST00000629904 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.61■■□□□ 1.69
PKP4-AS1-203ENST00000629904 KIF27Q86VH2 1401 aa25.61■■□□□ 1.69
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.6■■□□□ 1.69
PKP4-AS1-203ENST00000629904 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.59■■□□□ 1.69
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CEP162Q5TB80 1403 aa25.55■■□□□ 1.68
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TOPBP1Q92547 1522 aa25.55■■□□□ 1.68
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.52■■□□□ 1.68
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CUX2O14529 1486 aa25.51■■□□□ 1.67
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PRXQ9BXM0 1461 aa25.48■■□□□ 1.67
PKP4-AS1-203ENST00000629904 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.47■■□□□ 1.67
PKP4-AS1-203ENST00000629904 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.45■■□□□ 1.67
PKP4-AS1-203ENST00000629904 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.43■■□□□ 1.66
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.41■■□□□ 1.66
PKP4-AS1-203ENST00000629904 IGF1RP08069 1367 aa25.38■■□□□ 1.65
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.36■■□□□ 1.65
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CLIP1P30622 1438 aa25.31■■□□□ 1.64
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.26■■□□□ 1.63
PKP4-AS1-203ENST00000629904 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.25■■□□□ 1.63
PKP4-AS1-203ENST00000629904 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PKP4-AS1-203ENST00000629904 WDR97A6NE52 1622 aa25.21■■□□□ 1.63
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.12■■□□□ 1.61
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ERCC6Q03468 1493 aa25.12■■□□□ 1.61
PKP4-AS1-203ENST00000629904 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.1■■□□□ 1.61
PKP4-AS1-203ENST00000629904 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.1■■□□□ 1.61
PKP4-AS1-203ENST00000629904 WDR62O43379 1518 aa25.09■■□□□ 1.61
PKP4-AS1-203ENST00000629904 CUL7Q14999 1698 aa25.08■■□□□ 1.61
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ARAP1Q96P48 1450 aa25.02■■□□□ 1.6
PKP4-AS1-203ENST00000629904 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PKP4-AS1-203ENST00000629904 IFT140Q96RY7 1462 aa24.97■■□□□ 1.59
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.97■■□□□ 1.59
PKP4-AS1-203ENST00000629904 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
PKP4-AS1-203ENST00000629904 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PKP4-AS1-203ENST00000629904 APLP2Q06481 763 aa24.91■■□□□ 1.58
PKP4-AS1-203ENST00000629904 PBRM1Q86U86 1689 aa24.89■■□□□ 1.58
PKP4-AS1-203ENST00000629904 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PKP4-AS1-203ENST00000629904 HRCP23327 699 aa24.88■■□□□ 1.57
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