Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCAP28676 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCAP28676 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCAP28676 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCAP28676 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCAP28676 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCAP28676 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCAP28676 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCAP28676 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms