RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064571.2

CBLN4-201, Transcript of cerebellin 4 precursor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBLN4, Length 3,024 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN4-201ENST00000064571 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.67■■■□□ 2.82
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CBLN4-201ENST00000064571 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.8■■■□□ 2.04
CBLN4-201ENST00000064571 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CBLN4-201ENST00000064571 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CBLN4-201ENST00000064571 ABCC9O60706 1549 aa26.95■■□□□ 1.9
CBLN4-201ENST00000064571 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.55■■□□□ 1.84
CBLN4-201ENST00000064571 SCRIBQ14160 1630 aa26.37■■□□□ 1.81
CBLN4-201ENST00000064571 NACADO15069 1562 aa26.02■■□□□ 1.76
CBLN4-201ENST00000064571 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.99■■□□□ 1.75
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CBLN4-201ENST00000064571 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
CBLN4-201ENST00000064571 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.81■■□□□ 1.72
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CBLN4-201ENST00000064571 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.75■■□□□ 1.71
CBLN4-201ENST00000064571 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.74■■□□□ 1.71
CBLN4-201ENST00000064571 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.72■■□□□ 1.71
CBLN4-201ENST00000064571 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CBLN4-201ENST00000064571 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.48■■□□□ 1.67
CBLN4-201ENST00000064571 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.29■■□□□ 1.64
CBLN4-201ENST00000064571 WIZO95785 1651 aa25.27■■□□□ 1.64
CBLN4-201ENST00000064571 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.19■■□□□ 1.62
CBLN4-201ENST00000064571 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.18■■□□□ 1.62
CBLN4-201ENST00000064571 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CBLN4-201ENST00000064571 TRIM41Q8WV44 630 aa25.14■■□□□ 1.62
CBLN4-201ENST00000064571 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.14■■□□□ 1.61
CBLN4-201ENST00000064571 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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CBLN4-201ENST00000064571 SMARCA2P51531 1590 aa24.62■■□□□ 1.53
CBLN4-201ENST00000064571 ABCC8Q09428 1581 aa24.58■■□□□ 1.53
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CBLN4-201ENST00000064571 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CBLN4-201ENST00000064571 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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CBLN4-201ENST00000064571 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.36■■□□□ 1.49
CBLN4-201ENST00000064571 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CBLN4-201ENST00000064571 SOGA1O94964 1423 aa24.28■■□□□ 1.48
CBLN4-201ENST00000064571 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
CBLN4-201ENST00000064571 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.2■■□□□ 1.46
CBLN4-201ENST00000064571 NCAPD3P42695 1498 aa24.18■■□□□ 1.46
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CBLN4-201ENST00000064571 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CBLN4-201ENST00000064571 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CBLN4-201ENST00000064571 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.1■■□□□ 1.45
CBLN4-201ENST00000064571 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.08■■□□□ 1.45
CBLN4-201ENST00000064571 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CBLN4-201ENST00000064571 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.02■■□□□ 1.44
CBLN4-201ENST00000064571 SYNJ1O43426 1573 aa24.02■■□□□ 1.44
CBLN4-201ENST00000064571 HMGXB3Q12766 1538 aa23.99■■□□□ 1.43
CBLN4-201ENST00000064571 NEUROD1Q13562 356 aa23.97■■□□□ 1.43
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CBLN4-201ENST00000064571 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
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CBLN4-201ENST00000064571 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.81■■□□□ 1.4
CBLN4-201ENST00000064571 NESP48681 1621 aa23.76■■□□□ 1.39
CBLN4-201ENST00000064571 CEP162Q5TB80 1403 aa23.75■■□□□ 1.39
CBLN4-201ENST00000064571 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CBLN4-201ENST00000064571 CUX1P39880 1505 aa23.72■■□□□ 1.39
CBLN4-201ENST00000064571 EEA1Q15075 1411 aa23.71■■□□□ 1.39
CBLN4-201ENST00000064571 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.67■■□□□ 1.38
CBLN4-201ENST00000064571 TOP2BQ02880 1626 aa23.66■■□□□ 1.38
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CBLN4-201ENST00000064571 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.65■■□□□ 1.38
CBLN4-201ENST00000064571 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CBLN4-201ENST00000064571 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CBLN4-201ENST00000064571 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.58■■□□□ 1.36
CBLN4-201ENST00000064571 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.57■■□□□ 1.36
CBLN4-201ENST00000064571 CUX2O14529 1486 aa23.51■■□□□ 1.35
CBLN4-201ENST00000064571 KIF27Q86VH2 1401 aa23.5■■□□□ 1.35
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CBLN4-201ENST00000064571 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.49■■□□□ 1.35
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CBLN4-201ENST00000064571 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.47■■□□□ 1.35
CBLN4-201ENST00000064571 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.44■■□□□ 1.34
CBLN4-201ENST00000064571 APLP2Q06481 763 aa23.37■■□□□ 1.33
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CBLN4-201ENST00000064571 PRXQ9BXM0 1461 aa23.34■■□□□ 1.33
CBLN4-201ENST00000064571 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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CBLN4-201ENST00000064571 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.29■■□□□ 1.32
CBLN4-201ENST00000064571 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CBLN4-201ENST00000064571 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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CBLN4-201ENST00000064571 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.25■■□□□ 1.31
CBLN4-201ENST00000064571 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CBLN4-201ENST00000064571 PRDM2Q13029 1718 aa23.23■■□□□ 1.31
CBLN4-201ENST00000064571 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.18■■□□□ 1.3
CBLN4-201ENST00000064571 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.17■■□□□ 1.3
CBLN4-201ENST00000064571 MYT1Q01538 1121 aa23.17■■□□□ 1.3
CBLN4-201ENST00000064571 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.17■■□□□ 1.3
CBLN4-201ENST00000064571 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CBLN4-201ENST00000064571 ARAP1Q96P48 1450 aa23.12■■□□□ 1.29
CBLN4-201ENST00000064571 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.12■■□□□ 1.29
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