Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
DKK2Q9UBU2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms