RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448422.2

FAM53B-AS1-202, FAM53B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B-AS1, Length 1,491 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.33■■■■□ 3.89
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.45■■■■□ 3.1
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.64■■■□□ 2.82
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ABCC9O60706 1549 aa32.62■■■□□ 2.81
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.44■■■□□ 2.78
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.38■■■□□ 2.77
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 NACADO15069 1562 aa32.17■■■□□ 2.74
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.92■■■□□ 2.7
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.72■■■□□ 2.67
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SCRIBQ14160 1630 aa31.48■■■□□ 2.63
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.08■■■□□ 2.57
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.84■■■□□ 2.53
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.7■■■□□ 2.5
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.47■■■□□ 2.47
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.29■■■□□ 2.44
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SMARCA4P51532 1647 aa30.25■■■□□ 2.43
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 WIZO95785 1651 aa30■■■□□ 2.39
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.97■■■□□ 2.39
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SMARCA2P51531 1590 aa29.88■■■□□ 2.37
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.84■■■□□ 2.37
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 NCAPD3P42695 1498 aa29.69■■■□□ 2.34
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 HMGXB3Q12766 1538 aa29.62■■■□□ 2.33
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.55■■■□□ 2.32
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.45■■■□□ 2.3
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.12■■■□□ 2.25
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CFTRP13569 1480 aa28.93■■■□□ 2.22
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.91■■■□□ 2.22
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.89■■■□□ 2.21
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 TRIM41Q8WV44 630 aa28.79■■■□□ 2.2
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 PRDM2Q13029 1718 aa28.72■■■□□ 2.19
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.7■■■□□ 2.19
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ABCC8Q09428 1581 aa28.66■■■□□ 2.18
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 NESP48681 1621 aa28.53■■■□□ 2.16
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.52■■■□□ 2.16
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.52■■■□□ 2.16
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SYNJ1O43426 1573 aa28.44■■■□□ 2.14
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 TOP2BQ02880 1626 aa28.43■■■□□ 2.14
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.4■■■□□ 2.14
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.39■■■□□ 2.13
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CUX1P39880 1505 aa28.35■■■□□ 2.13
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 EEA1Q15075 1411 aa28.25■■■□□ 2.11
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.24■■■□□ 2.11
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.2■■■□□ 2.11
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 TOPBP1Q92547 1522 aa28.18■■■□□ 2.1
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SOGA1O94964 1423 aa28.12■■■□□ 2.09
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.1■■■□□ 2.09
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.1■■■□□ 2.09
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ERCC6Q03468 1493 aa28.08■■■□□ 2.09
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.02■■■□□ 2.08
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 KIF27Q86VH2 1401 aa27.99■■■□□ 2.07
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.98■■■□□ 2.07
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 WDR62O43379 1518 aa27.95■■■□□ 2.07
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.92■■■□□ 2.06
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.89■■■□□ 2.06
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CUX2O14529 1486 aa27.89■■■□□ 2.05
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.86■■■□□ 2.05
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 KIF21BO75037 1637 aa27.77■■■□□ 2.04
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 IFT140Q96RY7 1462 aa27.77■■■□□ 2.04
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 WDR97A6NE52 1622 aa27.76■■■□□ 2.03
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 GOLGA3Q08378 1498 aa27.74■■■□□ 2.03
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 IGF1RP08069 1367 aa27.72■■■□□ 2.03
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 PRXQ9BXM0 1461 aa27.71■■■□□ 2.03
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.67■■■□□ 2.02
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.65■■■□□ 2.02
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.65■■■□□ 2.02
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.63■■■□□ 2.01
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.6■■■□□ 2.01
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.59■■■□□ 2.01
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.58■■■□□ 2.01
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CUL7Q14999 1698 aa27.56■■■□□ 2
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 GRIN2BQ13224 1484 aa27.49■■□□□ 1.99
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 PBRM1Q86U86 1689 aa27.42■■□□□ 1.98
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.39■■□□□ 1.97
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CEP162Q5TB80 1403 aa27.39■■□□□ 1.97
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 ADAMTS12P58397 1594 aa27.3■■□□□ 1.96
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CLIP1P30622 1438 aa27.26■■□□□ 1.95
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 SYNJ2O15056 1496 aa27.18■■□□□ 1.94
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.14■■□□□ 1.94
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 GRIN2AQ12879 1464 aa27.12■■□□□ 1.93
FAM53B-AS1-202ENST00000448422 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
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