RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.01■■■■□ 3.2
GINS2-201ENST00000253462 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.13■■■□□ 2.41
GINS2-201ENST00000253462 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
GINS2-201ENST00000253462 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.33■■■□□ 2.29
GINS2-201ENST00000253462 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.26■■■□□ 2.27
GINS2-201ENST00000253462 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.73■■■□□ 2.19
GINS2-201ENST00000253462 ABCC9O60706 1549 aa28.48■■■□□ 2.15
GINS2-201ENST00000253462 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
GINS2-201ENST00000253462 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.17■■■□□ 2.1
GINS2-201ENST00000253462 SCRIBQ14160 1630 aa28.1■■■□□ 2.09
GINS2-201ENST00000253462 NACADO15069 1562 aa28.01■■■□□ 2.07
GINS2-201ENST00000253462 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.72■■■□□ 2.03
GINS2-201ENST00000253462 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
GINS2-201ENST00000253462 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.34■■□□□ 1.97
GINS2-201ENST00000253462 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.3■■□□□ 1.96
GINS2-201ENST00000253462 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.3■■□□□ 1.96
GINS2-201ENST00000253462 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.18■■□□□ 1.94
GINS2-201ENST00000253462 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
GINS2-201ENST00000253462 WIZO95785 1651 aa27.02■■□□□ 1.92
GINS2-201ENST00000253462 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
GINS2-201ENST00000253462 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.95■■□□□ 1.91
GINS2-201ENST00000253462 SMARCA4P51532 1647 aa26.82■■□□□ 1.88
GINS2-201ENST00000253462 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GINS2-201ENST00000253462 TRIM41Q8WV44 630 aa26.56■■□□□ 1.84
GINS2-201ENST00000253462 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.47■■□□□ 1.83
GINS2-201ENST00000253462 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.44■■□□□ 1.82
GINS2-201ENST00000253462 SMARCA2P51531 1590 aa26.41■■□□□ 1.82
GINS2-201ENST00000253462 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.33■■□□□ 1.81
GINS2-201ENST00000253462 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
GINS2-201ENST00000253462 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GINS2-201ENST00000253462 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.29■■□□□ 1.8
GINS2-201ENST00000253462 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.2■■□□□ 1.78
GINS2-201ENST00000253462 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
GINS2-201ENST00000253462 ABCC8Q09428 1581 aa26.15■■□□□ 1.78
GINS2-201ENST00000253462 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.11■■□□□ 1.77
GINS2-201ENST00000253462 HRCP23327 699 aa26.11■■□□□ 1.77
GINS2-201ENST00000253462 NCAPD3P42695 1498 aa25.9■■□□□ 1.74
GINS2-201ENST00000253462 HMGXB3Q12766 1538 aa25.85■■□□□ 1.73
GINS2-201ENST00000253462 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
GINS2-201ENST00000253462 SOGA1O94964 1423 aa25.75■■□□□ 1.71
GINS2-201ENST00000253462 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
GINS2-201ENST00000253462 SYNJ1O43426 1573 aa25.69■■□□□ 1.7
GINS2-201ENST00000253462 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.67■■□□□ 1.7
GINS2-201ENST00000253462 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.65■■□□□ 1.7
GINS2-201ENST00000253462 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
GINS2-201ENST00000253462 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.56■■□□□ 1.68
GINS2-201ENST00000253462 CFTRP13569 1480 aa25.5■■□□□ 1.67
GINS2-201ENST00000253462 EEA1Q15075 1411 aa25.5■■□□□ 1.67
GINS2-201ENST00000253462 TOP2BQ02880 1626 aa25.45■■□□□ 1.66
GINS2-201ENST00000253462 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
GINS2-201ENST00000253462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.37■■□□□ 1.65
GINS2-201ENST00000253462 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.36■■□□□ 1.65
GINS2-201ENST00000253462 CUX1P39880 1505 aa25.35■■□□□ 1.65
GINS2-201ENST00000253462 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.31■■□□□ 1.64
GINS2-201ENST00000253462 PRDM2Q13029 1718 aa25.31■■□□□ 1.64
GINS2-201ENST00000253462 CEP162Q5TB80 1403 aa25.3■■□□□ 1.64
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA3Q08378 1498 aa25.3■■□□□ 1.64
GINS2-201ENST00000253462 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.24■■□□□ 1.63
GINS2-201ENST00000253462 KIF21BO75037 1637 aa25.19■■□□□ 1.62
GINS2-201ENST00000253462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.18■■□□□ 1.62
GINS2-201ENST00000253462 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.16■■□□□ 1.62
GINS2-201ENST00000253462 NESP48681 1621 aa25.16■■□□□ 1.62
GINS2-201ENST00000253462 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.12■■□□□ 1.61
GINS2-201ENST00000253462 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GINS2-201ENST00000253462 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GINS2-201ENST00000253462 KIF27Q86VH2 1401 aa25.07■■□□□ 1.6
GINS2-201ENST00000253462 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.02■■□□□ 1.6
GINS2-201ENST00000253462 CLIP1P30622 1438 aa24.99■■□□□ 1.59
GINS2-201ENST00000253462 PRXQ9BXM0 1461 aa24.99■■□□□ 1.59
GINS2-201ENST00000253462 CUX2O14529 1486 aa24.98■■□□□ 1.59
GINS2-201ENST00000253462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.93■■□□□ 1.58
GINS2-201ENST00000253462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.91■■□□□ 1.58
GINS2-201ENST00000253462 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
GINS2-201ENST00000253462 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.88■■□□□ 1.57
GINS2-201ENST00000253462 TOPBP1Q92547 1522 aa24.87■■□□□ 1.57
GINS2-201ENST00000253462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.85■■□□□ 1.57
GINS2-201ENST00000253462 IGF1RP08069 1367 aa24.85■■□□□ 1.57
GINS2-201ENST00000253462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
GINS2-201ENST00000253462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.79■■□□□ 1.56
GINS2-201ENST00000253462 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GINS2-201ENST00000253462 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.78■■□□□ 1.56
GINS2-201ENST00000253462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.75■■□□□ 1.55
GINS2-201ENST00000253462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.75■■□□□ 1.55
GINS2-201ENST00000253462 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GINS2-201ENST00000253462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.7■■□□□ 1.54
GINS2-201ENST00000253462 APLP2Q06481 763 aa24.69■■□□□ 1.54
GINS2-201ENST00000253462 ARAP1Q96P48 1450 aa24.65■■□□□ 1.54
GINS2-201ENST00000253462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
GINS2-201ENST00000253462 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.58■■□□□ 1.52
GINS2-201ENST00000253462 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
GINS2-201ENST00000253462 WDR97A6NE52 1622 aa24.55■■□□□ 1.52
GINS2-201ENST00000253462 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.47■■□□□ 1.51
GINS2-201ENST00000253462 P3H3Q8IVL6 736 aa24.46■■□□□ 1.51
GINS2-201ENST00000253462 CUL7Q14999 1698 aa24.46■■□□□ 1.51
GINS2-201ENST00000253462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.45■■□□□ 1.51
GINS2-201ENST00000253462 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
GINS2-201ENST00000253462 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.44■■□□□ 1.5
GINS2-201ENST00000253462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
GINS2-201ENST00000253462 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
GINS2-201ENST00000253462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 33
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