RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611680.1

SELENOM-210, Transcript of selenoprotein M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SELENOM, Length 689 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOM-210ENST00000611680 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.54■■■■■ 4.4
SELENOM-210ENST00000611680 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.04■■■■□ 3.68
SELENOM-210ENST00000611680 ABCC9O60706 1549 aa37.7■■■■□ 3.63
SELENOM-210ENST00000611680 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.04■■■■□ 3.36
SELENOM-210ENST00000611680 NACADO15069 1562 aa35.88■■■■□ 3.33
SELENOM-210ENST00000611680 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.71■■■■□ 3.31
SELENOM-210ENST00000611680 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.52■■■■□ 3.28
SELENOM-210ENST00000611680 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
SELENOM-210ENST00000611680 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.23■■■■□ 3.23
SELENOM-210ENST00000611680 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.17■■■■□ 3.22
SELENOM-210ENST00000611680 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
SELENOM-210ENST00000611680 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.08■■■■□ 3.21
SELENOM-210ENST00000611680 BICRAQ9NZM4 1560 aa35■■■■□ 3.19
SELENOM-210ENST00000611680 SCRIBQ14160 1630 aa34.66■■■■□ 3.14
SELENOM-210ENST00000611680 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.56■■■■□ 3.12
SELENOM-210ENST00000611680 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
SELENOM-210ENST00000611680 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.08■■■■□ 3.05
SELENOM-210ENST00000611680 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.93■■■■□ 3.02
SELENOM-210ENST00000611680 NCAPD3P42695 1498 aa33.12■■■□□ 2.89
SELENOM-210ENST00000611680 SMARCA4P51532 1647 aa33.11■■■□□ 2.89
SELENOM-210ENST00000611680 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.05■■■□□ 2.88
SELENOM-210ENST00000611680 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
SELENOM-210ENST00000611680 SMARCA2P51531 1590 aa32.98■■■□□ 2.87
SELENOM-210ENST00000611680 HMGXB3Q12766 1538 aa32.91■■■□□ 2.86
SELENOM-210ENST00000611680 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.81■■■□□ 2.84
SELENOM-210ENST00000611680 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.78■■■□□ 2.84
SELENOM-210ENST00000611680 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
SELENOM-210ENST00000611680 ERCC6Q03468 1493 aa32.52■■■□□ 2.8
SELENOM-210ENST00000611680 NESP48681 1621 aa32.48■■■□□ 2.79
SELENOM-210ENST00000611680 WIZO95785 1651 aa32.4■■■□□ 2.78
SELENOM-210ENST00000611680 CUX2O14529 1486 aa32.36■■■□□ 2.77
SELENOM-210ENST00000611680 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.32■■■□□ 2.76
SELENOM-210ENST00000611680 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
SELENOM-210ENST00000611680 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.12■■■□□ 2.73
SELENOM-210ENST00000611680 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.1■■■□□ 2.73
SELENOM-210ENST00000611680 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SELENOM-210ENST00000611680 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.08■■■□□ 2.73
SELENOM-210ENST00000611680 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
SELENOM-210ENST00000611680 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.98■■■□□ 2.71
SELENOM-210ENST00000611680 CFTRP13569 1480 aa31.84■■■□□ 2.69
SELENOM-210ENST00000611680 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.82■■■□□ 2.68
SELENOM-210ENST00000611680 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.75■■■□□ 2.67
SELENOM-210ENST00000611680 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.75■■■□□ 2.67
SELENOM-210ENST00000611680 WDR62O43379 1518 aa31.74■■■□□ 2.67
SELENOM-210ENST00000611680 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.65■■■□□ 2.66
SELENOM-210ENST00000611680 PRDM2Q13029 1718 aa31.55■■■□□ 2.64
SELENOM-210ENST00000611680 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
SELENOM-210ENST00000611680 TOPBP1Q92547 1522 aa31.19■■■□□ 2.58
SELENOM-210ENST00000611680 ABCC8Q09428 1581 aa31.15■■■□□ 2.58
SELENOM-210ENST00000611680 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.11■■■□□ 2.57
SELENOM-210ENST00000611680 IFT140Q96RY7 1462 aa31.11■■■□□ 2.57
SELENOM-210ENST00000611680 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
SELENOM-210ENST00000611680 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
SELENOM-210ENST00000611680 OSCARQ8IYS5 282 aa30.93■■■□□ 2.54
SELENOM-210ENST00000611680 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
SELENOM-210ENST00000611680 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
SELENOM-210ENST00000611680 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
SELENOM-210ENST00000611680 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.521e-6■■■■■ 27.1
SELENOM-210ENST00000611680 CUX1P39880 1505 aa30.78■■■□□ 2.52
SELENOM-210ENST00000611680 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.76■■■□□ 2.52
SELENOM-210ENST00000611680 SOGA1O94964 1423 aa30.75■■■□□ 2.51
SELENOM-210ENST00000611680 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.75■■■□□ 2.51
SELENOM-210ENST00000611680 TRIM41Q8WV44 630 aa30.67■■■□□ 2.5
SELENOM-210ENST00000611680 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
SELENOM-210ENST00000611680 WDR97A6NE52 1622 aa30.61■■■□□ 2.49
SELENOM-210ENST00000611680 CHD1O14646 1710 aa30.59■■■□□ 2.49
SELENOM-210ENST00000611680 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.5■■■□□ 2.47
SELENOM-210ENST00000611680 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.5■■■□□ 2.47
SELENOM-210ENST00000611680 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.5■■■□□ 2.47
SELENOM-210ENST00000611680 FBLN2P98095 1184 aa30.49■■■□□ 2.47
SELENOM-210ENST00000611680 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.48■■■□□ 2.47
SELENOM-210ENST00000611680 GRIN2BQ13224 1484 aa30.45■■■□□ 2.47
SELENOM-210ENST00000611680 ARHGEF11O15085 1522 aa30.44■■■□□ 2.46
SELENOM-210ENST00000611680 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
SELENOM-210ENST00000611680 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.42■■■□□ 2.46
SELENOM-210ENST00000611680 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.38■■■□□ 2.45
SELENOM-210ENST00000611680 TOP2BQ02880 1626 aa30.38■■■□□ 2.45
SELENOM-210ENST00000611680 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.38■■■□□ 2.45
SELENOM-210ENST00000611680 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
SELENOM-210ENST00000611680 SYNJ1O43426 1573 aa30.36■■■□□ 2.45
SELENOM-210ENST00000611680 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.36■■■□□ 2.45
SELENOM-210ENST00000611680 PBRM1Q86U86 1689 aa30.36■■■□□ 2.45
SELENOM-210ENST00000611680 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
SELENOM-210ENST00000611680 SYNJ2O15056 1496 aa30.32■■■□□ 2.44
SELENOM-210ENST00000611680 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.26■■■□□ 2.43
SELENOM-210ENST00000611680 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.18■■■□□ 2.42
SELENOM-210ENST00000611680 ARAP1Q96P48 1450 aa30.17■■■□□ 2.42
SELENOM-210ENST00000611680 ADAMTS12P58397 1594 aa30.09■■■□□ 2.41
SELENOM-210ENST00000611680 GRIN2AQ12879 1464 aa30.06■■■□□ 2.4
SELENOM-210ENST00000611680 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.05■■■□□ 2.4
SELENOM-210ENST00000611680 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.02■■■□□ 2.4
SELENOM-210ENST00000611680 NUP160Q12769 1436 aa29.96■■■□□ 2.39
SELENOM-210ENST00000611680 CEP170Q5SW79 1584 aa29.94■■■□□ 2.38
SELENOM-210ENST00000611680 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.81■■■□□ 2.36
SELENOM-210ENST00000611680 SHROOM2Q13796 1616 aa29.8■■■□□ 2.36
SELENOM-210ENST00000611680 KIF27Q86VH2 1401 aa29.78■■■□□ 2.36
SELENOM-210ENST00000611680 IGF1RP08069 1367 aa29.74■■■□□ 2.35
SELENOM-210ENST00000611680 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SELENOM-210ENST00000611680 CUL7Q14999 1698 aa29.68■■■□□ 2.34
SELENOM-210ENST00000611680 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.67■■■□□ 2.34
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