Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.124e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.174e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 UBE2I-211ENST00000564143 444 ntTSL 313.56□□□□□ -0.244e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.274e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 UBE2I-214ENST00000566775 396 ntTSL 38.3□□□□□ -1.084e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 STIP1-208ENST00000540501 880 ntTSL 326.15■■□□□ 1.784e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.324e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-215ENST00000544485 543 ntTSL 422.03■■□□□ 1.124e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.094e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.064e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.044e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)21.18■□□□□ 0.984e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.967e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-210ENST00000535524 809 ntTSL 220.93■□□□□ 0.944e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 EIF5A-209ENST00000573714 602 ntTSL 320.93■□□□□ 0.944e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-212ENST00000477814 1784 ntTSL 220.72■□□□□ 0.915e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 220.58■□□□□ 0.884e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 SEMA4C-202ENST00000442264 817 ntTSL 320.53■□□□□ 0.884e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.864e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.834e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.727e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.694e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-204ENST00000429374 1634 ntTSL 1 (best)19.36■□□□□ 0.695e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-214ENST00000543477 563 ntTSL 419.19■□□□□ 0.664e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 219.07■□□□□ 0.645e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-221ENST00000498366 2153 ntTSL 518.96■□□□□ 0.635e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-214ENST00000483222 2091 ntTSL 518.84■□□□□ 0.615e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.64e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.64e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 218.67■□□□□ 0.584e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.534e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.524e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.525e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.475e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.435e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-203ENST00000415993 2375 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.415e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.45e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-206ENST00000454936 1922 ntTSL 217.36■□□□□ 0.375e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.364e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF44-202ENST00000504160 887 ntTSL 317.26■□□□□ 0.354e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.284e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.254e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 AMPD2-223ENST00000531734 572 ntTSL 416.11■□□□□ 0.172e-12■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.144e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CRLF1-202ENST00000593286 514 ntTSL 415.94■□□□□ 0.144e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 AMPD2-209ENST00000474459 814 ntTSL 415.82■□□□□ 0.122e-12■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF19A-204ENST00000519342 562 ntTSL 415.59■□□□□ 0.094e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 FXYD2-203ENST00000317594 1567 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.064e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PALB2-205ENST00000567003 789 ntTSL 315.27■□□□□ 0.044e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.034e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.014e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PKD1P6-202ENST00000424133 2493 ntTSL 1 (best)14.83□□□□□ -0.044e-18■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 314.72□□□□□ -0.054e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.064e-18■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.074e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.144e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.164e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CCP110-211ENST00000573412 673 ntTSL 314.02□□□□□ -0.174e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 KLF6-201ENST00000173785 925 ntTSL 213.68□□□□□ -0.224e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 ANGPTL8-202ENST00000587543 432 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.254e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 213.5□□□□□ -0.254e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 STIP1-204ENST00000536973 738 ntTSL 513.22□□□□□ -0.294e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 513.15□□□□□ -0.34e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 BDP1-204ENST00000508917 7194 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF40-211ENST00000567365 597 ntTSL 312.54□□□□□ -0.44e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CCP110-210ENST00000569190 2600 ntTSL 212.5□□□□□ -0.414e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CCP110-205ENST00000562083 595 ntTSL 312.33□□□□□ -0.444e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.484e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 AMPD2-208ENST00000469039 513 ntTSL 411.99□□□□□ -0.492e-12■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.574e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PALB2-206ENST00000568219 3963 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.654e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 STIP1-211ENST00000543847 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.684e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.74e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 PALB2-201ENST00000261584 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.774e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CCP110-207ENST00000565376 698 ntTSL 310.16□□□□□ -0.784e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.814e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CEP192-208ENST00000510237 6548 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.024e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF19A-209ENST00000522182 544 ntTSL 48.46□□□□□ -1.064e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF19A-210ENST00000522369 612 ntTSL 48.46□□□□□ -1.064e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 RNF19A-213ENST00000523481 547 ntTSL 47.78□□□□□ -1.164e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 CEP192-209ENST00000511820 6455 ntTSL 1 (best)6.04□□□□□ -1.444e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 STIP1-209ENST00000540736 399 ntTSL 25.58□□□□□ -1.524e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.541e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.614e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 BDP1-203ENST00000508157 3403 ntTSL 54.98□□□□□ -1.614e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 ARHGAP18-203ENST00000483367 460 ntTSL 34.67□□□□□ -1.661e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 ARHGAP18-202ENST00000463225 464 ntTSL 33.25□□□□□ -1.891e-6■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 33.11□□□□□ -1.914e-7■■□□□ 11.6
RBM22Q9NW64 FXN-204ENST00000484259 359 ntTSL 32.93□□□□□ -1.944e-7■■□□□ 11.6
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