Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FOXE3Q13461 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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FOXE3Q13461 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
FOXE3Q13461 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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