RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.06■■■■□ 3.68
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TVP23C-201ENST00000225576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.04■■■□□ 2.24
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TVP23C-201ENST00000225576 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.79■■■□□ 2.2
TVP23C-201ENST00000225576 SMARCA2P51531 1590 aa28.77■■■□□ 2.2
TVP23C-201ENST00000225576 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.61■■■□□ 2.17
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TVP23C-201ENST00000225576 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.56■■■□□ 2.16
TVP23C-201ENST00000225576 HMGXB3Q12766 1538 aa28.5■■■□□ 2.15
TVP23C-201ENST00000225576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.36■■■□□ 2.13
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TVP23C-201ENST00000225576 CFTRP13569 1480 aa27.93■■■□□ 2.06
TVP23C-201ENST00000225576 ABCC8Q09428 1581 aa27.89■■■□□ 2.06
TVP23C-201ENST00000225576 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.83■■■□□ 2.05
TVP23C-201ENST00000225576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
TVP23C-201ENST00000225576 PRDM2Q13029 1718 aa27.65■■■□□ 2.02
TVP23C-201ENST00000225576 SYNJ1O43426 1573 aa27.62■■■□□ 2.01
TVP23C-201ENST00000225576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.55■■■□□ 2
TVP23C-201ENST00000225576 TOP2BQ02880 1626 aa27.54■■■□□ 2
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TVP23C-201ENST00000225576 NESP48681 1621 aa27.51■■□□□ 1.99
TVP23C-201ENST00000225576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.49■■□□□ 1.99
TVP23C-201ENST00000225576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.49■■□□□ 1.99
TVP23C-201ENST00000225576 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.47■■□□□ 1.99
TVP23C-201ENST00000225576 CUX1P39880 1505 aa27.47■■□□□ 1.99
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TVP23C-201ENST00000225576 SOGA1O94964 1423 aa27.42■■□□□ 1.98
TVP23C-201ENST00000225576 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.38■■□□□ 1.97
TVP23C-201ENST00000225576 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.31■■□□□ 1.96
TVP23C-201ENST00000225576 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.3■■□□□ 1.96
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TVP23C-201ENST00000225576 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.24■■□□□ 1.95
TVP23C-201ENST00000225576 TOPBP1Q92547 1522 aa27.19■■□□□ 1.94
TVP23C-201ENST00000225576 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.17■■□□□ 1.94
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TVP23C-201ENST00000225576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.12■■□□□ 1.93
TVP23C-201ENST00000225576 KIF27Q86VH2 1401 aa27.11■■□□□ 1.93
TVP23C-201ENST00000225576 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.07■■□□□ 1.92
TVP23C-201ENST00000225576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
TVP23C-201ENST00000225576 KIF21BO75037 1637 aa27.01■■□□□ 1.91
TVP23C-201ENST00000225576 CUX2O14529 1486 aa27.01■■□□□ 1.91
TVP23C-201ENST00000225576 GOLGA3Q08378 1498 aa27.01■■□□□ 1.91
TVP23C-201ENST00000225576 MRC2Q9UBG0 1479 aa27■■□□□ 1.91
TVP23C-201ENST00000225576 ERCC6Q03468 1493 aa26.99■■□□□ 1.91
TVP23C-201ENST00000225576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.97■■□□□ 1.91
TVP23C-201ENST00000225576 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.96■■□□□ 1.91
TVP23C-201ENST00000225576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.95■■□□□ 1.9
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TVP23C-201ENST00000225576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.86■■□□□ 1.89
TVP23C-201ENST00000225576 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.86■■□□□ 1.89
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TVP23C-201ENST00000225576 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.79■■□□□ 1.88
TVP23C-201ENST00000225576 CEP162Q5TB80 1403 aa26.77■■□□□ 1.88
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TVP23C-201ENST00000225576 IFT140Q96RY7 1462 aa26.69■■□□□ 1.86
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TVP23C-201ENST00000225576 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
TVP23C-201ENST00000225576 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
TVP23C-201ENST00000225576 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TVP23C-201ENST00000225576 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.35■■□□□ 1.81
TVP23C-201ENST00000225576 ADAMTS12P58397 1594 aa26.35■■□□□ 1.81
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.31■■□□□ 1.8
TVP23C-201ENST00000225576 ARAP1Q96P48 1450 aa26.3■■□□□ 1.8
TVP23C-201ENST00000225576 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.27■■□□□ 1.8
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