Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL9A2Q14055 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL9A2Q14055 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL9A2Q14055 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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