RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249042.7

TST-201, Transcript of thiosulfate sulfurtransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TST, Length 1,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TST-201ENST00000249042 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.15■■■■■ 6.74
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TST-201ENST00000249042 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.41■■■■■ 5.34
TST-201ENST00000249042 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.22■■■■■ 5.31
TST-201ENST00000249042 NACADO15069 1562 aa48.14■■■■■ 5.3
TST-201ENST00000249042 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.51■■■■■ 5.2
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TST-201ENST00000249042 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.44■■■■■ 5.19
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TST-201ENST00000249042 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.24■■■■■ 4.99
TST-201ENST00000249042 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.81■■■■■ 4.92
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TST-201ENST00000249042 SMARCA4P51532 1647 aa44.54■■■■■ 4.72
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TST-201ENST00000249042 SMARCA2P51531 1590 aa44.31■■■■■ 4.68
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TST-201ENST00000249042 ERCC6Q03468 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
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TST-201ENST00000249042 WIZO95785 1651 aa43.67■■■■■ 4.58
TST-201ENST00000249042 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.39■■■■■ 4.54
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TST-201ENST00000249042 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
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TST-201ENST00000249042 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.74■■■■■ 4.43
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TST-201ENST00000249042 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.7■■■■■ 4.43
TST-201ENST00000249042 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.68■■■■■ 4.42
TST-201ENST00000249042 WDR62O43379 1518 aa42.6■■■■■ 4.41
TST-201ENST00000249042 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.57■■■■■ 4.41
TST-201ENST00000249042 PRDM2Q13029 1718 aa42.49■■■■■ 4.39
TST-201ENST00000249042 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
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TST-201ENST00000249042 TOPBP1Q92547 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
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TST-201ENST00000249042 ABCC8Q09428 1581 aa41.79■■■■■ 4.28
TST-201ENST00000249042 IFT140Q96RY7 1462 aa41.77■■■■■ 4.28
TST-201ENST00000249042 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
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TST-201ENST00000249042 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
TST-201ENST00000249042 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
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TST-201ENST00000249042 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.42■■■■■ 4.22
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TST-201ENST00000249042 TRIM41Q8WV44 630 aa41.31■■■■■ 4.2
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TST-201ENST00000249042 CHD1O14646 1710 aa41.22■■■■■ 4.19
TST-201ENST00000249042 FBLN2P98095 1184 aa41.13■■■■■ 4.17
TST-201ENST00000249042 WDR97A6NE52 1622 aa41.07■■■■■ 4.17
TST-201ENST00000249042 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.02■■■■■ 4.16
TST-201ENST00000249042 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
TST-201ENST00000249042 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
TST-201ENST00000249042 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.01■■■■■ 4.16
TST-201ENST00000249042 PBRM1Q86U86 1689 aa40.93■■■■■ 4.14
TST-201ENST00000249042 GRIN2BQ13224 1484 aa40.92■■■■■ 4.14
TST-201ENST00000249042 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
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TST-201ENST00000249042 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.89■■■■■ 4.14
TST-201ENST00000249042 ARHGEF11O15085 1522 aa40.88■■■■■ 4.14
TST-201ENST00000249042 TOP2BQ02880 1626 aa40.86■■■■■ 4.13
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TST-201ENST00000249042 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
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TST-201ENST00000249042 CEP170Q5SW79 1584 aa40.29■■■■■ 4.04
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TST-201ENST00000249042 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
TST-201ENST00000249042 SHROOM2Q13796 1616 aa40.01■■■■■ 4
TST-201ENST00000249042 CUL7Q14999 1698 aa39.94■■■■□ 3.98
TST-201ENST00000249042 IGF1RP08069 1367 aa39.94■■■■□ 3.98
TST-201ENST00000249042 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.91■■■■□ 3.98
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