Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
COL9A2Q14055 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COL9A2Q14055 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
COL9A2Q14055 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
COL9A2Q14055 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
COL9A2Q14055 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
COL9A2Q14055 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
COL9A2Q14055 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
COL9A2Q14055 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
COL9A2Q14055 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
COL9A2Q14055 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COL9A2Q14055 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL9A2Q14055 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
COL9A2Q14055 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
COL9A2Q14055 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
COL9A2Q14055 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
COL9A2Q14055 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
COL9A2Q14055 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
COL9A2Q14055 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
COL9A2Q14055 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COL9A2Q14055 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
COL9A2Q14055 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
COL9A2Q14055 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
COL9A2Q14055 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL9A2Q14055 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
COL9A2Q14055 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
COL9A2Q14055 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL9A2Q14055 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
COL9A2Q14055 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
COL9A2Q14055 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL9A2Q14055 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL9A2Q14055 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
COL9A2Q14055 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL9A2Q14055 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL9A2Q14055 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL9A2Q14055 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL9A2Q14055 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL9A2Q14055 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
COL9A2Q14055 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COL9A2Q14055 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL9A2Q14055 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL9A2Q14055 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COL9A2Q14055 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COL9A2Q14055 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COL9A2Q14055 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COL9A2Q14055 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
COL9A2Q14055 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL9A2Q14055 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL9A2Q14055 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL9A2Q14055 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL9A2Q14055 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL9A2Q14055 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL9A2Q14055 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL9A2Q14055 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL9A2Q14055 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL9A2Q14055 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL9A2Q14055 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL9A2Q14055 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL9A2Q14055 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL9A2Q14055 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL9A2Q14055 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL9A2Q14055 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL9A2Q14055 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COL9A2Q14055 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL9A2Q14055 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL9A2Q14055 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL9A2Q14055 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL9A2Q14055 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL9A2Q14055 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL9A2Q14055 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL9A2Q14055 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL9A2Q14055 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL9A2Q14055 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL9A2Q14055 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL9A2Q14055 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL9A2Q14055 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL9A2Q14055 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A2Q14055 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL9A2Q14055 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL9A2Q14055 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL9A2Q14055 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL9A2Q14055 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL9A2Q14055 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL9A2Q14055 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL9A2Q14055 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL9A2Q14055 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL9A2Q14055 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL9A2Q14055 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL9A2Q14055 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL9A2Q14055 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL9A2Q14055 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COL9A2Q14055 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL9A2Q14055 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL9A2Q14055 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL9A2Q14055 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL9A2Q14055 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL9A2Q14055 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL9A2Q14055 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COL9A2Q14055 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
COL9A2Q14055 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
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