Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRIM54Q9BYV2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM54Q9BYV2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms