RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308941.9

PHYHD1-201, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PHYHD1, Length 1,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-201ENST00000308941 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.69■■■■■ 4.26
PHYHD1-201ENST00000308941 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.04■■■■□ 3.52
PHYHD1-201ENST00000308941 ABCC9O60706 1549 aa36.41■■■■□ 3.42
PHYHD1-201ENST00000308941 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.91■■■■□ 3.18
PHYHD1-201ENST00000308941 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.87■■■■□ 3.17
PHYHD1-201ENST00000308941 NACADO15069 1562 aa34.79■■■■□ 3.16
PHYHD1-201ENST00000308941 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
PHYHD1-201ENST00000308941 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.5■■■■□ 3.11
PHYHD1-201ENST00000308941 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.39■■■■□ 3.1
PHYHD1-201ENST00000308941 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.27■■■■□ 3.08
PHYHD1-201ENST00000308941 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
PHYHD1-201ENST00000308941 SCRIBQ14160 1630 aa33.94■■■■□ 3.02
PHYHD1-201ENST00000308941 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.94■■■■□ 3.02
PHYHD1-201ENST00000308941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.49■■■□□ 2.95
PHYHD1-201ENST00000308941 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.32■■■□□ 2.92
PHYHD1-201ENST00000308941 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
PHYHD1-201ENST00000308941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.9■■■□□ 2.86
PHYHD1-201ENST00000308941 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.64■■■□□ 2.82
PHYHD1-201ENST00000308941 SMARCA4P51532 1647 aa32.39■■■□□ 2.78
PHYHD1-201ENST00000308941 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
PHYHD1-201ENST00000308941 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.21■■■□□ 2.75
PHYHD1-201ENST00000308941 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.19■■■□□ 2.74
PHYHD1-201ENST00000308941 NCAPD3P42695 1498 aa32.11■■■□□ 2.73
PHYHD1-201ENST00000308941 SMARCA2P51531 1590 aa32.08■■■□□ 2.73
PHYHD1-201ENST00000308941 PEG3Q9GZU2 1588 aa32■■■□□ 2.71
PHYHD1-201ENST00000308941 HMGXB3Q12766 1538 aa31.97■■■□□ 2.71
PHYHD1-201ENST00000308941 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
PHYHD1-201ENST00000308941 WIZO95785 1651 aa31.9■■■□□ 2.7
PHYHD1-201ENST00000308941 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
PHYHD1-201ENST00000308941 NESP48681 1621 aa31.53■■■□□ 2.64
PHYHD1-201ENST00000308941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
PHYHD1-201ENST00000308941 ERCC6Q03468 1493 aa31.29■■■□□ 2.6
PHYHD1-201ENST00000308941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.29■■■□□ 2.6
PHYHD1-201ENST00000308941 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.19■■■□□ 2.58
PHYHD1-201ENST00000308941 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.16■■■□□ 2.58
PHYHD1-201ENST00000308941 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.12■■■□□ 2.57
PHYHD1-201ENST00000308941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.04■■■□□ 2.56
PHYHD1-201ENST00000308941 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PHYHD1-201ENST00000308941 CFTRP13569 1480 aa31.01■■■□□ 2.56
PHYHD1-201ENST00000308941 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
PHYHD1-201ENST00000308941 CUX2O14529 1486 aa30.9■■■□□ 2.54
PHYHD1-201ENST00000308941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.89■■■□□ 2.54
PHYHD1-201ENST00000308941 PRDM2Q13029 1718 aa30.84■■■□□ 2.53
PHYHD1-201ENST00000308941 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.83■■■□□ 2.53
PHYHD1-201ENST00000308941 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.79■■■□□ 2.52
PHYHD1-201ENST00000308941 WDR62O43379 1518 aa30.7■■■□□ 2.51
PHYHD1-201ENST00000308941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
PHYHD1-201ENST00000308941 TOPBP1Q92547 1522 aa30.4■■■□□ 2.46
PHYHD1-201ENST00000308941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.34■■■□□ 2.45
PHYHD1-201ENST00000308941 ABCC8Q09428 1581 aa30.24■■■□□ 2.43
PHYHD1-201ENST00000308941 CUX1P39880 1505 aa30.21■■■□□ 2.43
PHYHD1-201ENST00000308941 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
PHYHD1-201ENST00000308941 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
PHYHD1-201ENST00000308941 IFT140Q96RY7 1462 aa30.15■■■□□ 2.42
PHYHD1-201ENST00000308941 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PHYHD1-201ENST00000308941 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.08■■■□□ 2.41
PHYHD1-201ENST00000308941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.08■■■□□ 2.41
PHYHD1-201ENST00000308941 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.03■■■□□ 2.4
PHYHD1-201ENST00000308941 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PHYHD1-201ENST00000308941 SOGA1O94964 1423 aa29.99■■■□□ 2.39
PHYHD1-201ENST00000308941 SYNJ1O43426 1573 aa29.97■■■□□ 2.39
PHYHD1-201ENST00000308941 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
PHYHD1-201ENST00000308941 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
PHYHD1-201ENST00000308941 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.9■■■□□ 2.38
PHYHD1-201ENST00000308941 TOP2BQ02880 1626 aa29.88■■■□□ 2.37
PHYHD1-201ENST00000308941 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
PHYHD1-201ENST00000308941 WDR97A6NE52 1622 aa29.87■■■□□ 2.37
PHYHD1-201ENST00000308941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.73■■■□□ 2.35
PHYHD1-201ENST00000308941 CHD1O14646 1710 aa29.68■■■□□ 2.34
PHYHD1-201ENST00000308941 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.67■■■□□ 2.34
PHYHD1-201ENST00000308941 PBRM1Q86U86 1689 aa29.67■■■□□ 2.34
PHYHD1-201ENST00000308941 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.66■■■□□ 2.34
PHYHD1-201ENST00000308941 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.64■■■□□ 2.34
PHYHD1-201ENST00000308941 OSCARQ8IYS5 282 aa29.62■■■□□ 2.33
PHYHD1-201ENST00000308941 GRIN2BQ13224 1484 aa29.61■■■□□ 2.33
PHYHD1-201ENST00000308941 FBLN2P98095 1184 aa29.58■■■□□ 2.33
PHYHD1-201ENST00000308941 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
PHYHD1-201ENST00000308941 SYNJ2O15056 1496 aa29.43■■■□□ 2.3
PHYHD1-201ENST00000308941 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
PHYHD1-201ENST00000308941 ADAMTS12P58397 1594 aa29.39■■■□□ 2.3
PHYHD1-201ENST00000308941 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.35■■■□□ 2.29
PHYHD1-201ENST00000308941 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.29■■■□□ 2.28
PHYHD1-201ENST00000308941 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.29■■■□□ 2.28
PHYHD1-201ENST00000308941 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.29■■■□□ 2.28
PHYHD1-201ENST00000308941 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.28■■■□□ 2.28
PHYHD1-201ENST00000308941 GRIN2AQ12879 1464 aa29.27■■■□□ 2.28
PHYHD1-201ENST00000308941 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.26■■■□□ 2.27
PHYHD1-201ENST00000308941 KIF27Q86VH2 1401 aa29.26■■■□□ 2.27
PHYHD1-201ENST00000308941 ARHGEF11O15085 1522 aa29.24■■■□□ 2.27
PHYHD1-201ENST00000308941 CEP170Q5SW79 1584 aa29.2■■■□□ 2.27
PHYHD1-201ENST00000308941 IGF1RP08069 1367 aa29.19■■■□□ 2.26
PHYHD1-201ENST00000308941 TRIM41Q8WV44 630 aa29.19■■■□□ 2.26
PHYHD1-201ENST00000308941 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.18■■■□□ 2.26
PHYHD1-201ENST00000308941 NUP160Q12769 1436 aa29.12■■■□□ 2.25
PHYHD1-201ENST00000308941 CUL7Q14999 1698 aa29.1■■■□□ 2.25
PHYHD1-201ENST00000308941 ARAP1Q96P48 1450 aa29.03■■■□□ 2.24
PHYHD1-201ENST00000308941 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.01■■■□□ 2.23
PHYHD1-201ENST00000308941 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29■■■□□ 2.23
PHYHD1-201ENST00000308941 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.97■■■□□ 2.23
PHYHD1-201ENST00000308941 SHROOM2Q13796 1616 aa28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.1 ms