Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CUL3Q13618 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL3Q13618 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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