Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CUL3Q13618 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CUL3Q13618 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CUL3Q13618 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CUL3Q13618 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CUL3Q13618 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CUL3Q13618 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CUL3Q13618 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CUL3Q13618 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CUL3Q13618 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CUL3Q13618 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CUL3Q13618 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CUL3Q13618 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CUL3Q13618 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CUL3Q13618 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CUL3Q13618 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CUL3Q13618 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CUL3Q13618 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CUL3Q13618 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CUL3Q13618 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CUL3Q13618 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CUL3Q13618 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CUL3Q13618 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CUL3Q13618 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CUL3Q13618 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CUL3Q13618 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CUL3Q13618 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CUL3Q13618 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CUL3Q13618 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CUL3Q13618 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CUL3Q13618 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CUL3Q13618 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CUL3Q13618 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CUL3Q13618 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CUL3Q13618 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CUL3Q13618 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CUL3Q13618 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CUL3Q13618 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CUL3Q13618 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CUL3Q13618 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CUL3Q13618 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CUL3Q13618 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CUL3Q13618 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CUL3Q13618 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CUL3Q13618 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CUL3Q13618 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CUL3Q13618 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CUL3Q13618 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CUL3Q13618 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CUL3Q13618 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL3Q13618 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL3Q13618 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL3Q13618 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL3Q13618 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL3Q13618 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL3Q13618 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL3Q13618 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL3Q13618 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL3Q13618 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL3Q13618 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CUL3Q13618 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CUL3Q13618 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CUL3Q13618 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CUL3Q13618 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CUL3Q13618 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CUL3Q13618 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL3Q13618 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CUL3Q13618 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUL3Q13618 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CUL3Q13618 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL3Q13618 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL3Q13618 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CUL3Q13618 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CUL3Q13618 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CUL3Q13618 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CUL3Q13618 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL3Q13618 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL3Q13618 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CUL3Q13618 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUL3Q13618 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL3Q13618 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL3Q13618 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL3Q13618 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL3Q13618 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL3Q13618 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL3Q13618 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL3Q13618 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CUL3Q13618 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL3Q13618 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CUL3Q13618 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL3Q13618 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL3Q13618 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CUL3Q13618 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUL3Q13618 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CUL3Q13618 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CUL3Q13618 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CUL3Q13618 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CUL3Q13618 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CUL3Q13618 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUL3Q13618 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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