RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.88■■■■□ 3.98
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USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCC9O60706 1549 aa33.59■■■□□ 2.97
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.1■■■□□ 2.89
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.02■■■□□ 2.88
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.85■■■□□ 2.85
USP3-AS1-201ENST00000558831 NACADO15069 1562 aa32.81■■■□□ 2.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.66■■■□□ 2.82
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.13■■■□□ 2.73
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCRIBQ14160 1630 aa32.12■■■□□ 2.73
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.91■■■□□ 2.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.6■■■□□ 2.65
USP3-AS1-201ENST00000558831 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.55■■■□□ 2.64
USP3-AS1-201ENST00000558831 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.98■■■□□ 2.55
USP3-AS1-201ENST00000558831 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMARCA4P51532 1647 aa30.78■■■□□ 2.52
USP3-AS1-201ENST00000558831 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.75■■■□□ 2.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
USP3-AS1-201ENST00000558831 WIZO95785 1651 aa30.48■■■□□ 2.47
USP3-AS1-201ENST00000558831 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.44■■■□□ 2.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMARCA2P51531 1590 aa30.42■■■□□ 2.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.41■■■□□ 2.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.4■■■□□ 2.46
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCAPD3P42695 1498 aa30.26■■■□□ 2.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 HMGXB3Q12766 1538 aa30.19■■■□□ 2.42
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.05■■■□□ 2.4
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.84■■■□□ 2.37
USP3-AS1-201ENST00000558831 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.44■■■□□ 2.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFTRP13569 1480 aa29.43■■■□□ 2.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.34■■■□□ 2.29
USP3-AS1-201ENST00000558831 NESP48681 1621 aa29.3■■■□□ 2.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRDM2Q13029 1718 aa29.28■■■□□ 2.28
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.24■■■□□ 2.27
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.14■■■□□ 2.26
USP3-AS1-201ENST00000558831 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.11■■■□□ 2.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCC8Q09428 1581 aa29.02■■■□□ 2.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEP164Q9UPV0 1460 aa29■■■□□ 2.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.98■■■□□ 2.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM41Q8WV44 630 aa28.96■■■□□ 2.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERCC6Q03468 1493 aa28.92■■■□□ 2.22
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYNJ1O43426 1573 aa28.81■■■□□ 2.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CUX1P39880 1505 aa28.81■■■□□ 2.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOP2BQ02880 1626 aa28.78■■■□□ 2.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.78■■■□□ 2.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.76■■■□□ 2.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.76■■■□□ 2.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOPBP1Q92547 1522 aa28.72■■■□□ 2.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR62O43379 1518 aa28.64■■■□□ 2.18
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.59■■■□□ 2.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOGA1O94964 1423 aa28.45■■■□□ 2.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.41■■■□□ 2.14
USP3-AS1-201ENST00000558831 CUX2O14529 1486 aa28.38■■■□□ 2.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.35■■■□□ 2.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFT140Q96RY7 1462 aa28.34■■■□□ 2.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
USP3-AS1-201ENST00000558831 EEA1Q15075 1411 aa28.29■■■□□ 2.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF27Q86VH2 1401 aa28.29■■■□□ 2.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR97A6NE52 1622 aa28.29■■■□□ 2.12
USP3-AS1-201ENST00000558831 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.26■■■□□ 2.11
USP3-AS1-201ENST00000558831 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.15■■■□□ 2.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.15■■■□□ 2.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.14■■■□□ 2.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.14■■■□□ 2.1
USP3-AS1-201ENST00000558831 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.1■■■□□ 2.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGF1RP08069 1367 aa28.05■■■□□ 2.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.03■■■□□ 2.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRIN2BQ13224 1484 aa28.02■■■□□ 2.08
USP3-AS1-201ENST00000558831 PBRM1Q86U86 1689 aa28.01■■■□□ 2.07
USP3-AS1-201ENST00000558831 CUL7Q14999 1698 aa27.94■■■□□ 2.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.93■■■□□ 2.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRXQ9BXM0 1461 aa27.92■■■□□ 2.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF21BO75037 1637 aa27.92■■■□□ 2.06
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.86■■■□□ 2.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.85■■■□□ 2.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA3Q08378 1498 aa27.84■■■□□ 2.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAMTS12P58397 1594 aa27.83■■■□□ 2.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.83■■■□□ 2.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYNJ2O15056 1496 aa27.74■■■□□ 2.03
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBLN2P98095 1184 aa27.67■■■□□ 2.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.67■■■□□ 2.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRIN2AQ12879 1464 aa27.65■■■□□ 2.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHD1O14646 1710 aa27.57■■■□□ 2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.53■■■□□ 2
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