RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640799.1

C1orf43-210, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene C1orf43, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-210ENST00000640799 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.28■■■■■ 4.68
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C1orf43-210ENST00000640799 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.52■■■■□ 3.6
C1orf43-210ENST00000640799 NACADO15069 1562 aa37.34■■■■□ 3.57
C1orf43-210ENST00000640799 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.26■■■■□ 3.56
C1orf43-210ENST00000640799 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.91■■■■□ 3.5
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C1orf43-210ENST00000640799 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.73■■■■□ 3.47
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C1orf43-210ENST00000640799 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.67■■■■□ 3.46
C1orf43-210ENST00000640799 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.57■■■■□ 3.44
C1orf43-210ENST00000640799 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.48■■■■□ 3.43
C1orf43-210ENST00000640799 SCRIBQ14160 1630 aa36.11■■■■□ 3.37
C1orf43-210ENST00000640799 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.92■■■■□ 3.34
C1orf43-210ENST00000640799 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.53■■■■□ 3.28
C1orf43-210ENST00000640799 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
C1orf43-210ENST00000640799 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.36■■■■□ 3.25
C1orf43-210ENST00000640799 NCAPD3P42695 1498 aa34.49■■■■□ 3.11
C1orf43-210ENST00000640799 SMARCA4P51532 1647 aa34.48■■■■□ 3.11
C1orf43-210ENST00000640799 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.43■■■■□ 3.1
C1orf43-210ENST00000640799 SMARCA2P51531 1590 aa34.32■■■■□ 3.09
C1orf43-210ENST00000640799 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.09
C1orf43-210ENST00000640799 HMGXB3Q12766 1538 aa34.24■■■■□ 3.07
C1orf43-210ENST00000640799 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.15■■■■□ 3.06
C1orf43-210ENST00000640799 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.13■■■■□ 3.05
C1orf43-210ENST00000640799 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
C1orf43-210ENST00000640799 NESP48681 1621 aa33.89■■■■□ 3.02
C1orf43-210ENST00000640799 ERCC6Q03468 1493 aa33.88■■■■□ 3.01
C1orf43-210ENST00000640799 WIZO95785 1651 aa33.75■■■□□ 2.99
C1orf43-210ENST00000640799 CUX2O14529 1486 aa33.71■■■□□ 2.99
C1orf43-210ENST00000640799 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.65■■■□□ 2.98
C1orf43-210ENST00000640799 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
C1orf43-210ENST00000640799 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.46■■■□□ 2.95
C1orf43-210ENST00000640799 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
C1orf43-210ENST00000640799 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.44■■■□□ 2.94
C1orf43-210ENST00000640799 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.44■■■□□ 2.94
C1orf43-210ENST00000640799 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.4■■■□□ 2.94
C1orf43-210ENST00000640799 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
C1orf43-210ENST00000640799 CFTRP13569 1480 aa33.14■■■□□ 2.9
C1orf43-210ENST00000640799 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.13■■■□□ 2.89
C1orf43-210ENST00000640799 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.07■■■□□ 2.88
C1orf43-210ENST00000640799 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.06■■■□□ 2.88
C1orf43-210ENST00000640799 WDR62O43379 1518 aa33.05■■■□□ 2.88
C1orf43-210ENST00000640799 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.96■■■□□ 2.87
C1orf43-210ENST00000640799 PRDM2Q13029 1718 aa32.82■■■□□ 2.84
C1orf43-210ENST00000640799 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
C1orf43-210ENST00000640799 TOPBP1Q92547 1522 aa32.48■■■□□ 2.79
C1orf43-210ENST00000640799 ABCC8Q09428 1581 aa32.4■■■□□ 2.78
C1orf43-210ENST00000640799 IFT140Q96RY7 1462 aa32.39■■■□□ 2.78
C1orf43-210ENST00000640799 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.38■■■□□ 2.77
C1orf43-210ENST00000640799 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
C1orf43-210ENST00000640799 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
C1orf43-210ENST00000640799 OSCARQ8IYS5 282 aa32.26■■■□□ 2.75
C1orf43-210ENST00000640799 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
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C1orf43-210ENST00000640799 CUX1P39880 1505 aa32.05■■■□□ 2.72
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C1orf43-210ENST00000640799 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.02■■■□□ 2.72
C1orf43-210ENST00000640799 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
C1orf43-210ENST00000640799 CHD1O14646 1710 aa31.88■■■□□ 2.69
C1orf43-210ENST00000640799 WDR97A6NE52 1622 aa31.82■■■□□ 2.69
C1orf43-210ENST00000640799 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.82■■■□□ 2.68
C1orf43-210ENST00000640799 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.82■■■□□ 2.68
C1orf43-210ENST00000640799 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.82■■■□□ 2.68
C1orf43-210ENST00000640799 FBLN2P98095 1184 aa31.81■■■□□ 2.68
C1orf43-210ENST00000640799 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.76■■■□□ 2.67
C1orf43-210ENST00000640799 ARHGEF11O15085 1522 aa31.74■■■□□ 2.67
C1orf43-210ENST00000640799 GRIN2BQ13224 1484 aa31.71■■■□□ 2.67
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C1orf43-210ENST00000640799 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.66■■■□□ 2.66
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C1orf43-210ENST00000640799 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
C1orf43-210ENST00000640799 PBRM1Q86U86 1689 aa31.61■■■□□ 2.65
C1orf43-210ENST00000640799 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.61■■■□□ 2.65
C1orf43-210ENST00000640799 TOP2BQ02880 1626 aa31.6■■■□□ 2.65
C1orf43-210ENST00000640799 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.6■■■□□ 2.65
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C1orf43-210ENST00000640799 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.6■■■□□ 2.65
C1orf43-210ENST00000640799 SYNJ2O15056 1496 aa31.57■■■□□ 2.64
C1orf43-210ENST00000640799 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.52■■■□□ 2.64
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C1orf43-210ENST00000640799 ARAP1Q96P48 1450 aa31.46■■■□□ 2.63
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C1orf43-210ENST00000640799 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.24■■■□□ 2.59
C1orf43-210ENST00000640799 CEP170Q5SW79 1584 aa31.2■■■□□ 2.58
C1orf43-210ENST00000640799 NUP160Q12769 1436 aa31.19■■■□□ 2.58
C1orf43-210ENST00000640799 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.09■■■□□ 2.57
C1orf43-210ENST00000640799 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
C1orf43-210ENST00000640799 SHROOM2Q13796 1616 aa31.02■■■□□ 2.56
C1orf43-210ENST00000640799 KIF27Q86VH2 1401 aa30.98■■■□□ 2.55
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C1orf43-210ENST00000640799 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.88■■■□□ 2.53
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