RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617979.4

GALE-216, Transcript of UDP-galactose-4-epimerase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALE, Length 1,566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALE-216ENST00000617979 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.4■■■■□ 3.74
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GALE-216ENST00000617979 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.09■■■□□ 2.73
GALE-216ENST00000617979 NACADO15069 1562 aa32.04■■■□□ 2.72
GALE-216ENST00000617979 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
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GALE-216ENST00000617979 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.33■■■□□ 2.612e-7■■■■■ 27.8
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GALE-216ENST00000617979 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.2■■■□□ 2.59
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GALE-216ENST00000617979 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.72■■■□□ 2.51
GALE-216ENST00000617979 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
GALE-216ENST00000617979 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.25■■■□□ 2.43
GALE-216ENST00000617979 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.04■■■□□ 2.4
GALE-216ENST00000617979 SMARCA4P51532 1647 aa29.81■■■□□ 2.36
GALE-216ENST00000617979 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
GALE-216ENST00000617979 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.65■■■□□ 2.34
GALE-216ENST00000617979 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.65■■■□□ 2.34
GALE-216ENST00000617979 NCAPD3P42695 1498 aa29.59■■■□□ 2.33
GALE-216ENST00000617979 SMARCA2P51531 1590 aa29.56■■■□□ 2.32
GALE-216ENST00000617979 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.46■■■□□ 2.31
GALE-216ENST00000617979 HMGXB3Q12766 1538 aa29.44■■■□□ 2.3
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GALE-216ENST00000617979 WIZO95785 1651 aa29.33■■■□□ 2.29
GALE-216ENST00000617979 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
GALE-216ENST00000617979 NESP48681 1621 aa29■■■□□ 2.23
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GALE-216ENST00000617979 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
GALE-216ENST00000617979 ERCC6Q03468 1493 aa28.82■■■□□ 2.2
GALE-216ENST00000617979 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.8■■■□□ 2.2
GALE-216ENST00000617979 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.74■■■□□ 2.19
GALE-216ENST00000617979 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.66■■■□□ 2.18
GALE-216ENST00000617979 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.6■■■□□ 2.17
GALE-216ENST00000617979 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.6■■■□□ 2.17
GALE-216ENST00000617979 CFTRP13569 1480 aa28.58■■■□□ 2.17
GALE-216ENST00000617979 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
GALE-216ENST00000617979 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.45■■■□□ 2.14
GALE-216ENST00000617979 CUX2O14529 1486 aa28.44■■■□□ 2.14
GALE-216ENST00000617979 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.4■■■□□ 2.14
GALE-216ENST00000617979 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.35■■■□□ 2.13
GALE-216ENST00000617979 PRDM2Q13029 1718 aa28.31■■■□□ 2.12
GALE-216ENST00000617979 WDR62O43379 1518 aa28.26■■■□□ 2.11
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GALE-216ENST00000617979 TOPBP1Q92547 1522 aa27.99■■■□□ 2.07
GALE-216ENST00000617979 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.99■■■□□ 2.07
GALE-216ENST00000617979 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.93■■■□□ 2.06
GALE-216ENST00000617979 ABCC8Q09428 1581 aa27.88■■■□□ 2.05
GALE-216ENST00000617979 CUX1P39880 1505 aa27.81■■■□□ 2.04
GALE-216ENST00000617979 IFT140Q96RY7 1462 aa27.77■■■□□ 2.04
GALE-216ENST00000617979 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
GALE-216ENST00000617979 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
GALE-216ENST00000617979 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.71■■■□□ 2.03
GALE-216ENST00000617979 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.69■■■□□ 2.02
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GALE-216ENST00000617979 SOGA1O94964 1423 aa27.63■■■□□ 2.01
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GALE-216ENST00000617979 SYNJ1O43426 1573 aa27.58■■■□□ 2.01
GALE-216ENST00000617979 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.017e-7■■■■□ 24.9
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GALE-216ENST00000617979 TOP2BQ02880 1626 aa27.52■■■□□ 2
GALE-216ENST00000617979 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.51■■□□□ 1.99
GALE-216ENST00000617979 WDR97A6NE52 1622 aa27.45■■□□□ 1.99
GALE-216ENST00000617979 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.39■■□□□ 1.98
GALE-216ENST00000617979 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.31■■□□□ 1.96
GALE-216ENST00000617979 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.31■■□□□ 1.96
GALE-216ENST00000617979 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.31■■□□□ 1.96
GALE-216ENST00000617979 OSCARQ8IYS5 282 aa27.29■■□□□ 1.96
GALE-216ENST00000617979 GRIN2BQ13224 1484 aa27.28■■□□□ 1.96
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GALE-216ENST00000617979 CHD1O14646 1710 aa27.24■■□□□ 1.95
GALE-216ENST00000617979 TRIM41Q8WV44 630 aa27.22■■□□□ 1.95
GALE-216ENST00000617979 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
GALE-216ENST00000617979 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GALE-216ENST00000617979 SYNJ2O15056 1496 aa27.12■■□□□ 1.93
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GALE-216ENST00000617979 KIF27Q86VH2 1401 aa27■■□□□ 1.91
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GALE-216ENST00000617979 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.9■■□□□ 1.9
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GALE-216ENST00000617979 ARHGEF11O15085 1522 aa26.9■■□□□ 1.9
GALE-216ENST00000617979 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.88■■□□□ 1.89
GALE-216ENST00000617979 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.87■■□□□ 1.89
GALE-216ENST00000617979 CEP170Q5SW79 1584 aa26.86■■□□□ 1.89
GALE-216ENST00000617979 NUP160Q12769 1436 aa26.83■■□□□ 1.89
GALE-216ENST00000617979 CUL7Q14999 1698 aa26.79■■□□□ 1.88
GALE-216ENST00000617979 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.75■■□□□ 1.87
GALE-216ENST00000617979 ARAP1Q96P48 1450 aa26.7■■□□□ 1.87
GALE-216ENST00000617979 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.67■■□□□ 1.86
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