Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms