RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463223.1

C9orf147-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 147, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C9orf147, Length 863 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf147-204ENST00000463223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.34■■■■■ 4.21
C9orf147-204ENST00000463223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.78■■■■□ 3.48
C9orf147-204ENST00000463223 ABCC9O60706 1549 aa35.63■■■■□ 3.29
C9orf147-204ENST00000463223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
C9orf147-204ENST00000463223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.46■■■■□ 3.11
C9orf147-204ENST00000463223 NACADO15069 1562 aa34.45■■■■□ 3.11
C9orf147-204ENST00000463223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.35■■■■□ 3.09
C9orf147-204ENST00000463223 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.3■■■■□ 3.08
C9orf147-204ENST00000463223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.25■■■■□ 3.07
C9orf147-204ENST00000463223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.75■■■□□ 2.99
C9orf147-204ENST00000463223 SCRIBQ14160 1630 aa33.52■■■□□ 2.96
C9orf147-204ENST00000463223 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.37■■■□□ 2.93
C9orf147-204ENST00000463223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.26■■■□□ 2.91
C9orf147-204ENST00000463223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.09■■■□□ 2.89
C9orf147-204ENST00000463223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
C9orf147-204ENST00000463223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.38■■■□□ 2.77
C9orf147-204ENST00000463223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.29■■■□□ 2.76
C9orf147-204ENST00000463223 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.14■■■□□ 2.74
C9orf147-204ENST00000463223 SMARCA4P51532 1647 aa32.09■■■□□ 2.73
C9orf147-204ENST00000463223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
C9orf147-204ENST00000463223 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.85■■■□□ 2.69
C9orf147-204ENST00000463223 SMARCA2P51531 1590 aa31.82■■■□□ 2.68
C9orf147-204ENST00000463223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.78■■■□□ 2.68
C9orf147-204ENST00000463223 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.76■■■□□ 2.67
C9orf147-204ENST00000463223 NCAPD3P42695 1498 aa31.72■■■□□ 2.67
C9orf147-204ENST00000463223 HMGXB3Q12766 1538 aa31.67■■■□□ 2.66
C9orf147-204ENST00000463223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
C9orf147-204ENST00000463223 WIZO95785 1651 aa31.57■■■□□ 2.65
C9orf147-204ENST00000463223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
C9orf147-204ENST00000463223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
C9orf147-204ENST00000463223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.93■■■□□ 2.54
C9orf147-204ENST00000463223 NESP48681 1621 aa30.9■■■□□ 2.54
C9orf147-204ENST00000463223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
C9orf147-204ENST00000463223 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.82■■■□□ 2.53
C9orf147-204ENST00000463223 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.8■■■□□ 2.52
C9orf147-204ENST00000463223 ERCC6Q03468 1493 aa30.74■■■□□ 2.51
C9orf147-204ENST00000463223 CFTRP13569 1480 aa30.69■■■□□ 2.5
C9orf147-204ENST00000463223 PRDM2Q13029 1718 aa30.67■■■□□ 2.5
C9orf147-204ENST00000463223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.66■■■□□ 2.5
C9orf147-204ENST00000463223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.65■■■□□ 2.5
C9orf147-204ENST00000463223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.49■■■□□ 2.47
C9orf147-204ENST00000463223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
C9orf147-204ENST00000463223 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.45■■■□□ 2.47
C9orf147-204ENST00000463223 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.36■■■□□ 2.45
C9orf147-204ENST00000463223 CUX2O14529 1486 aa30.34■■■□□ 2.45
C9orf147-204ENST00000463223 WDR62O43379 1518 aa30.27■■■□□ 2.44
C9orf147-204ENST00000463223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
C9orf147-204ENST00000463223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.07■■■□□ 2.4
C9orf147-204ENST00000463223 ABCC8Q09428 1581 aa30.06■■■□□ 2.4
C9orf147-204ENST00000463223 TOPBP1Q92547 1522 aa30.03■■■□□ 2.4
C9orf147-204ENST00000463223 CUX1P39880 1505 aa29.89■■■□□ 2.38
C9orf147-204ENST00000463223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
C9orf147-204ENST00000463223 IFT140Q96RY7 1462 aa29.79■■■□□ 2.36
C9orf147-204ENST00000463223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.76■■■□□ 2.35
C9orf147-204ENST00000463223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.35
C9orf147-204ENST00000463223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf147-204ENST00000463223 TOP2BQ02880 1626 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf147-204ENST00000463223 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
C9orf147-204ENST00000463223 SYNJ1O43426 1573 aa29.72■■■□□ 2.35
C9orf147-204ENST00000463223 SOGA1O94964 1423 aa29.63■■■□□ 2.33
C9orf147-204ENST00000463223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.62■■■□□ 2.33
C9orf147-204ENST00000463223 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
C9orf147-204ENST00000463223 WDR97A6NE52 1622 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf147-204ENST00000463223 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
C9orf147-204ENST00000463223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.48■■■□□ 2.31
C9orf147-204ENST00000463223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
C9orf147-204ENST00000463223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
C9orf147-204ENST00000463223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.39■■■□□ 2.3
C9orf147-204ENST00000463223 PBRM1Q86U86 1689 aa29.37■■■□□ 2.29
C9orf147-204ENST00000463223 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.33■■■□□ 2.29
C9orf147-204ENST00000463223 GRIN2BQ13224 1484 aa29.3■■■□□ 2.28
C9orf147-204ENST00000463223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.23■■■□□ 2.27
C9orf147-204ENST00000463223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
C9orf147-204ENST00000463223 CHD1O14646 1710 aa29.21■■■□□ 2.27
C9orf147-204ENST00000463223 TRIM41Q8WV44 630 aa29.16■■■□□ 2.26
C9orf147-204ENST00000463223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.15■■■□□ 2.26
C9orf147-204ENST00000463223 KIF27Q86VH2 1401 aa29.12■■■□□ 2.25
C9orf147-204ENST00000463223 ADAMTS12P58397 1594 aa29.1■■■□□ 2.25
C9orf147-204ENST00000463223 SYNJ2O15056 1496 aa29.09■■■□□ 2.25
C9orf147-204ENST00000463223 FBLN2P98095 1184 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf147-204ENST00000463223 OSCARQ8IYS5 282 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf147-204ENST00000463223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.03■■■□□ 2.24
C9orf147-204ENST00000463223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
C9orf147-204ENST00000463223 CUL7Q14999 1698 aa28.99■■■□□ 2.23
C9orf147-204ENST00000463223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.99■■■□□ 2.23
C9orf147-204ENST00000463223 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.93■■■□□ 2.22
C9orf147-204ENST00000463223 GRIN2AQ12879 1464 aa28.92■■■□□ 2.22
C9orf147-204ENST00000463223 IGF1RP08069 1367 aa28.92■■■□□ 2.22
C9orf147-204ENST00000463223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.89■■■□□ 2.21
C9orf147-204ENST00000463223 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.84■■■□□ 2.21
C9orf147-204ENST00000463223 CEP170Q5SW79 1584 aa28.79■■■□□ 2.2
C9orf147-204ENST00000463223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.78■■■□□ 2.2
C9orf147-204ENST00000463223 NUP160Q12769 1436 aa28.77■■■□□ 2.2
C9orf147-204ENST00000463223 EEA1Q15075 1411 aa28.75■■■□□ 2.19
C9orf147-204ENST00000463223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.67■■■□□ 2.18
C9orf147-204ENST00000463223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.65■■■□□ 2.18
C9orf147-204ENST00000463223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.65■■■□□ 2.18
C9orf147-204ENST00000463223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.65■■■□□ 2.18
C9orf147-204ENST00000463223 ARHGEF11O15085 1522 aa28.64■■■□□ 2.18
C9orf147-204ENST00000463223 PRXQ9BXM0 1461 aa28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.7 ms