RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526117.5

LMX1B-203, Transcript of LIM homeobox transcription factor 1 beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMX1B, Length 1,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMX1B-203ENST00000526117 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.95■■■■■ 4.31
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LMX1B-203ENST00000526117 NACADO15069 1562 aa35.04■■■■□ 3.2
LMX1B-203ENST00000526117 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.01■■■■□ 3.2
LMX1B-203ENST00000526117 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
LMX1B-203ENST00000526117 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.98■■■■□ 3.19
LMX1B-203ENST00000526117 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.85■■■■□ 3.17
LMX1B-203ENST00000526117 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.69■■■■□ 3.14
LMX1B-203ENST00000526117 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.17■■■■□ 3.06
LMX1B-203ENST00000526117 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.94■■■■□ 3.02
LMX1B-203ENST00000526117 SCRIBQ14160 1630 aa33.89■■■■□ 3.02
LMX1B-203ENST00000526117 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.76■■■□□ 2.99
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LMX1B-203ENST00000526117 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.81■■■□□ 2.84
LMX1B-203ENST00000526117 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.57■■■□□ 2.8
LMX1B-203ENST00000526117 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
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LMX1B-203ENST00000526117 SMARCA2P51531 1590 aa32.32■■■□□ 2.76
LMX1B-203ENST00000526117 NCAPD3P42695 1498 aa32.31■■■□□ 2.76
LMX1B-203ENST00000526117 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.3■■■□□ 2.76
LMX1B-203ENST00000526117 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.3■■■□□ 2.76
LMX1B-203ENST00000526117 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.28■■■□□ 2.76
LMX1B-203ENST00000526117 HMGXB3Q12766 1538 aa32.21■■■□□ 2.75
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LMX1B-203ENST00000526117 WIZO95785 1651 aa31.91■■■□□ 2.7
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LMX1B-203ENST00000526117 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.45■■■□□ 2.63
LMX1B-203ENST00000526117 NESP48681 1621 aa31.35■■■□□ 2.61
LMX1B-203ENST00000526117 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.32■■■□□ 2.6
LMX1B-203ENST00000526117 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.23■■■□□ 2.59
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LMX1B-203ENST00000526117 ERCC6Q03468 1493 aa31.2■■■□□ 2.58
LMX1B-203ENST00000526117 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.18■■■□□ 2.58
LMX1B-203ENST00000526117 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.04■■■□□ 2.56
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LMX1B-203ENST00000526117 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.95■■■□□ 2.54
LMX1B-203ENST00000526117 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.91■■■□□ 2.54
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LMX1B-203ENST00000526117 WDR62O43379 1518 aa30.79■■■□□ 2.52
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LMX1B-203ENST00000526117 ABCC8Q09428 1581 aa30.56■■■□□ 2.48
LMX1B-203ENST00000526117 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.49■■■□□ 2.47
LMX1B-203ENST00000526117 TOPBP1Q92547 1522 aa30.47■■■□□ 2.47
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LMX1B-203ENST00000526117 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.14■■■□□ 2.42
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LMX1B-203ENST00000526117 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.01■■■□□ 2.4
LMX1B-203ENST00000526117 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
LMX1B-203ENST00000526117 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.94■■■□□ 2.38
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LMX1B-203ENST00000526117 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
LMX1B-203ENST00000526117 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.81■■■□□ 2.36
LMX1B-203ENST00000526117 GRIN2BQ13224 1484 aa29.75■■■□□ 2.35
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LMX1B-203ENST00000526117 PBRM1Q86U86 1689 aa29.69■■■□□ 2.34
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LMX1B-203ENST00000526117 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.6■■■□□ 2.33
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LMX1B-203ENST00000526117 CHD1O14646 1710 aa29.56■■■□□ 2.32
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LMX1B-203ENST00000526117 KIF27Q86VH2 1401 aa29.5■■■□□ 2.31
LMX1B-203ENST00000526117 ADAMTS12P58397 1594 aa29.49■■■□□ 2.31
LMX1B-203ENST00000526117 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.44■■■□□ 2.3
LMX1B-203ENST00000526117 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
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LMX1B-203ENST00000526117 FBLN2P98095 1184 aa29.38■■■□□ 2.29
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LMX1B-203ENST00000526117 CEP170Q5SW79 1584 aa29.19■■■□□ 2.26
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LMX1B-203ENST00000526117 ARHGEF11O15085 1522 aa29.15■■■□□ 2.26
LMX1B-203ENST00000526117 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.14■■■□□ 2.26
LMX1B-203ENST00000526117 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
LMX1B-203ENST00000526117 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
LMX1B-203ENST00000526117 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
LMX1B-203ENST00000526117 EEA1Q15075 1411 aa29.09■■■□□ 2.25
LMX1B-203ENST00000526117 SHROOM2Q13796 1616 aa29.05■■■□□ 2.24
LMX1B-203ENST00000526117 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.04■■■□□ 2.24
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