RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.8■■■□□ 2.2
EHD3-201ENST00000322054 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.68■■■□□ 2.18
EHD3-201ENST00000322054 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
EHD3-201ENST00000322054 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD3-201ENST00000322054 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.21■■□□□ 1.79
EHD3-201ENST00000322054 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
EHD3-201ENST00000322054 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.42■■□□□ 1.66
EHD3-201ENST00000322054 APLP2Q06481 763 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD3-201ENST00000322054 TRIM41Q8WV44 630 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD3-201ENST00000322054 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
EHD3-201ENST00000322054 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
EHD3-201ENST00000322054 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
EHD3-201ENST00000322054 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.8■■□□□ 1.56
EHD3-201ENST00000322054 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
EHD3-201ENST00000322054 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
EHD3-201ENST00000322054 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
EHD3-201ENST00000322054 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
EHD3-201ENST00000322054 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.64■■□□□ 1.54
EHD3-201ENST00000322054 ABCC9O60706 1549 aa24.53■■□□□ 1.52
EHD3-201ENST00000322054 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
EHD3-201ENST00000322054 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
EHD3-201ENST00000322054 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
EHD3-201ENST00000322054 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
EHD3-201ENST00000322054 HRCP23327 699 aa24.21■■□□□ 1.47
EHD3-201ENST00000322054 ITGAEP38570 1179 aa24.04■■□□□ 1.44
EHD3-201ENST00000322054 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
EHD3-201ENST00000322054 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
EHD3-201ENST00000322054 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
EHD3-201ENST00000322054 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
EHD3-201ENST00000322054 MYT1Q01538 1121 aa23.84■■□□□ 1.41
EHD3-201ENST00000322054 SCRIBQ14160 1630 aa23.6■■□□□ 1.37
EHD3-201ENST00000322054 NEFLP07196 543 aa23.6■■□□□ 1.37
EHD3-201ENST00000322054 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.57■■□□□ 1.36
EHD3-201ENST00000322054 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD3-201ENST00000322054 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
EHD3-201ENST00000322054 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD3-201ENST00000322054 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.44■■□□□ 1.34
EHD3-201ENST00000322054 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
EHD3-201ENST00000322054 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.38■■□□□ 1.33
EHD3-201ENST00000322054 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
EHD3-201ENST00000322054 P3H3Q8IVL6 736 aa23.24■■□□□ 1.31
EHD3-201ENST00000322054 NEUROD1Q13562 356 aa23.21■■□□□ 1.31
EHD3-201ENST00000322054 TRIM52Q96A61 297 aa23.21■■□□□ 1.31
EHD3-201ENST00000322054 FBLN2P98095 1184 aa23.19■■□□□ 1.3
EHD3-201ENST00000322054 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
EHD3-201ENST00000322054 ARID3CA6NKF2 412 aa23.04■■□□□ 1.28
EHD3-201ENST00000322054 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.03■■□□□ 1.28
EHD3-201ENST00000322054 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
EHD3-201ENST00000322054 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.97■■□□□ 1.27
EHD3-201ENST00000322054 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.93■■□□□ 1.26
EHD3-201ENST00000322054 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
EHD3-201ENST00000322054 NACADO15069 1562 aa22.87■■□□□ 1.25
EHD3-201ENST00000322054 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
EHD3-201ENST00000322054 ANP32CO43423 234 aa22.78■■□□□ 1.24
EHD3-201ENST00000322054 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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EHD3-201ENST00000322054 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
EHD3-201ENST00000322054 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.71■■□□□ 1.23
EHD3-201ENST00000322054 CLIP1P30622 1438 aa22.68■■□□□ 1.22
EHD3-201ENST00000322054 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
EHD3-201ENST00000322054 BCANQ96GW7 911 aa22.61■■□□□ 1.21
EHD3-201ENST00000322054 EEA1Q15075 1411 aa22.6■■□□□ 1.21
EHD3-201ENST00000322054 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
EHD3-201ENST00000322054 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
EHD3-201ENST00000322054 CEP162Q5TB80 1403 aa22.57■■□□□ 1.2
EHD3-201ENST00000322054 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
EHD3-201ENST00000322054 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
EHD3-201ENST00000322054 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.53■■□□□ 1.2
EHD3-201ENST00000322054 GOLGA3Q08378 1498 aa22.52■■□□□ 1.2
EHD3-201ENST00000322054 TONSLQ96HA7 1378 aa22.52■■□□□ 1.2
EHD3-201ENST00000322054 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.47■■□□□ 1.19
EHD3-201ENST00000322054 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.43■■□□□ 1.18
EHD3-201ENST00000322054 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
EHD3-201ENST00000322054 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.4■■□□□ 1.18
EHD3-201ENST00000322054 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
EHD3-201ENST00000322054 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.38■■□□□ 1.17
EHD3-201ENST00000322054 KIF27Q86VH2 1401 aa22.37■■□□□ 1.17
EHD3-201ENST00000322054 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.34■■□□□ 1.17
EHD3-201ENST00000322054 SOGA1O94964 1423 aa22.29■■□□□ 1.16
EHD3-201ENST00000322054 TSPY4P0CV99 314 aa22.28■■□□□ 1.16
EHD3-201ENST00000322054 TSPY10P0CW01 314 aa22.28■■□□□ 1.16
EHD3-201ENST00000322054 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.26■■□□□ 1.15
EHD3-201ENST00000322054 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
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EHD3-201ENST00000322054 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
EHD3-201ENST00000322054 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.21■■□□□ 1.15
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EHD3-201ENST00000322054 MIER1Q8N108 512 aa22.21■■□□□ 1.15
EHD3-201ENST00000322054 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
EHD3-201ENST00000322054 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.15■■□□□ 1.14
EHD3-201ENST00000322054 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.14■■□□□ 1.13
EHD3-201ENST00000322054 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
EHD3-201ENST00000322054 FKBP8Q14318 412 aa22.12■■□□□ 1.13
EHD3-201ENST00000322054 ABCC8Q09428 1581 aa22.11■■□□□ 1.13
EHD3-201ENST00000322054 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.1■■□□□ 1.13
EHD3-201ENST00000322054 CUX2O14529 1486 aa22.07■■□□□ 1.12
EHD3-201ENST00000322054 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.07■■□□□ 1.12
EHD3-201ENST00000322054 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
EHD3-201ENST00000322054 KCNH8Q96L42 1107 aa22.06■■□□□ 1.12
EHD3-201ENST00000322054 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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