Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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