RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542022.1

ARAP1-AS1-201, ARAP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ARAP1-AS1, Length 388 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.44■■■■■ 4.38
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.83■■■■□ 3.65
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ABCC9O60706 1549 aa36.79■■■■□ 3.48
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.55■■■■□ 3.28
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 NACADO15069 1562 aa35.55■■■■□ 3.28
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.43■■■■□ 3.26
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.25■■■■□ 3.23
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.2■■■■□ 3.23
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.65■■■■□ 3.14
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.4■■■■□ 3.1
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SCRIBQ14160 1630 aa34.33■■■■□ 3.09
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.29■■■■□ 3.08
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.28■■■■□ 3.08
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.67■■■□□ 2.98
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.35■■■□□ 2.93
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.12■■■□□ 2.89
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SMARCA4P51532 1647 aa32.92■■■□□ 2.86
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 NCAPD3P42695 1498 aa32.77■■■□□ 2.84
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SMARCA2P51531 1590 aa32.77■■■□□ 2.84
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.74■■■□□ 2.83
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.7■■■□□ 2.82
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 HMGXB3Q12766 1538 aa32.65■■■□□ 2.82
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.63■■■□□ 2.81
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 WIZO95785 1651 aa32.26■■■□□ 2.75
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.93■■■□□ 2.7
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 NESP48681 1621 aa31.82■■■□□ 2.68
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ERCC6Q03468 1493 aa31.78■■■□□ 2.68
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.78■■■□□ 2.68
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.68■■■□□ 2.66
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CFTRP13569 1480 aa31.61■■■□□ 2.65
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.57■■■□□ 2.64
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CUX2O14529 1486 aa31.55■■■□□ 2.64
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.51■■■□□ 2.63
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 PRDM2Q13029 1718 aa31.41■■■□□ 2.62
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.4■■■□□ 2.62
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.38■■■□□ 2.61
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.33■■■□□ 2.61
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 WDR62O43379 1518 aa31.26■■■□□ 2.59
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ABCC8Q09428 1581 aa31■■■□□ 2.55
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.9■■■□□ 2.54
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 TOPBP1Q92547 1522 aa30.89■■■□□ 2.54
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 IFT140Q96RY7 1462 aa30.75■■■□□ 2.51
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CUX1P39880 1505 aa30.63■■■□□ 2.49
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.53■■■□□ 2.48
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 WDR97A6NE52 1622 aa30.49■■■□□ 2.47
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SOGA1O94964 1423 aa30.47■■■□□ 2.47
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.46■■■□□ 2.47
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.46
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 TOP2BQ02880 1626 aa30.44■■■□□ 2.46
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.44■■■□□ 2.46
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.4■■■□□ 2.46
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SYNJ1O43426 1573 aa30.35■■■□□ 2.45
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.31■■■□□ 2.44
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 GRIN2BQ13224 1484 aa30.18■■■□□ 2.42
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.18■■■□□ 2.42
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.15■■■□□ 2.42
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 OSCARQ8IYS5 282 aa30.13■■■□□ 2.41
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 PBRM1Q86U86 1689 aa30.09■■■□□ 2.41
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.08■■■□□ 2.41
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CHD1O14646 1710 aa30.02■■■□□ 2.4
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SYNJ2O15056 1496 aa29.99■■■□□ 2.39
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.97■■■□□ 2.39
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 FBLN2P98095 1184 aa29.88■■■□□ 2.37
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ADAMTS12P58397 1594 aa29.88■■■□□ 2.37
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 KIF27Q86VH2 1401 aa29.86■■■□□ 2.37
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.84■■■□□ 2.37
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 GRIN2AQ12879 1464 aa29.78■■■□□ 2.36
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.77■■■□□ 2.36
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CUL7Q14999 1698 aa29.7■■■□□ 2.35
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 IGF1RP08069 1367 aa29.67■■■□□ 2.34
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ARHGEF11O15085 1522 aa29.67■■■□□ 2.34
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 NUP160Q12769 1436 aa29.67■■■□□ 2.34
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.65■■■□□ 2.34
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 TRIM41Q8WV44 630 aa29.65■■■□□ 2.34
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CEP170Q5SW79 1584 aa29.6■■■□□ 2.33
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.51■■■□□ 2.31
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 SHROOM2Q13796 1616 aa29.46■■■□□ 2.31
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.45■■■□□ 2.3
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 ARAP1Q96P48 1450 aa29.42■■■□□ 2.3
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.39■■■□□ 2.3
ARAP1-AS1-201ENST00000542022 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.37■■■□□ 2.29
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