Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TSFM-209ENST00000548851 794 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.493e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 GEMIN4-201ENST00000319004 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 GTF2B-201ENST00000370500 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 ACAA1-210ENST00000451419 964 ntTSL 310.62□□□□□ -0.713e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 STN1-203ENST00000466828 1414 ntTSL 59.26□□□□□ -0.933e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.942e-13■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.962e-13■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.983e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-13■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.162e-13■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.222e-13■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 IPO11-213ENST00000512177 599 ntTSL 37.38□□□□□ -1.233e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 SEC63-204ENST00000459782 2025 ntTSL 1 (best)6.6□□□□□ -1.353e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 PDCD4-204ENST00000462577 789 ntTSL 56.13□□□□□ -1.433e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.673e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.53□□□□□ -1.843e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 POLE4-204ENST00000473023 357 ntTSL 53.43□□□□□ -1.863e-7■■□□□ 12.7
PABPC4Q13310 DNAJC11-204ENST00000451196 1357 ntTSL 1 (best)23.4■■□□□ 1.342e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DNAJC11-206ENST00000465508 3014 ntTSL 214.84□□□□□ -0.032e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.195e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.825e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.361e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 EEF1D-234ENST00000530616 749 ntTSL 316.3■□□□□ 0.24e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 FAM173A-204ENST00000566437 800 ntTSL 328■■■□□ 2.072e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 APLP2-207ENST00000525604 1590 ntTSL 218.28■□□□□ 0.524e-8■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.064e-8■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 MARCH7-208ENST00000478396 797 ntTSL 57.28□□□□□ -1.249e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.318e-9■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 MCM5-201ENST00000216122 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.68e-9■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPS7-208ENST00000481006 5429 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.398e-9■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPS7-203ENST00000406376 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.558e-9■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPS2-211ENST00000531065 1548 ntTSL 532.51■■■□□ 2.86e-48■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.66e-48■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPS2-205ENST00000527109 1030 ntTSL 1 (best)31.29■■■□□ 2.66e-48■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.366e-48■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPS2-208ENST00000527871 1243 ntTSL 1 (best)29.68■■■□□ 2.346e-48■■□□□ 12.6
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PABPC4Q13310 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.45□□□□□ -1.543e-27■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 12.6
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PABPC4Q13310 KIF22-206ENST00000565736 1568 ntTSL 221.48■■□□□ 1.031e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.911e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 KIF22-207ENST00000568312 781 ntTSL 314.17□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.49e-8■■□□□ 12.6
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PABPC4Q13310 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.563e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.883e-7■■□□□ 12.6
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PABPC4Q13310 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.193e-8■■□□□ 12.6
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PABPC4Q13310 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.855e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.545e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.595e-7■■□□□ 12.6
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PABPC4Q13310 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.955e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CKAP2-204ENST00000459902 798 ntTSL 29.13□□□□□ -0.955e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 OSGEP-208ENST00000555656 3258 ntTSL 28.01□□□□□ -1.135e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 VEGFB-203ENST00000541681 225 ntTSL 37.44□□□□□ -1.225e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.365e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 ATIC-211ENST00000467388 714 ntTSL 25.67□□□□□ -1.55e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 ATIC-209ENST00000446622 615 ntTSL 35.58□□□□□ -1.525e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 HSPA14-201ENST00000378372 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 EEF1D-221ENST00000528382 308 ntTSL 521.02■□□□□ 0.963e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 IMPDH2-202ENST00000429182 1469 ntTSL 514.83□□□□□ -0.033e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.272e-9■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-9■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-9■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.522e-13■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-13■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CCT2-203ENST00000544368 1728 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.652e-13■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CCT2-208ENST00000550010 1754 ntTSL 59.83□□□□□ -0.842e-13■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CCT2-211ENST00000550653 567 ntTSL 26.01□□□□□ -1.452e-13■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.981e-8■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PRKCSH-203ENST00000586486 1613 ntTSL 1 (best)19.75■□□□□ 0.751e-8■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PRKCSH-213ENST00000591510 591 ntTSL 318.94■□□□□ 0.621e-8■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.298e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DAZAP2-215ENST00000604900 1045 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.268e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DAZAP2-203ENST00000436900 1811 ntTSL 513.32□□□□□ -0.288e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DAZAP2-205ENST00000449723 2098 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.388e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DAZAP2-214ENST00000552459 3664 ntTSL 212.07□□□□□ -0.488e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -18e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 NMT1-205ENST00000587120 573 ntTSL 517.85■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 NMT1-201ENST00000258960 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.371e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.051e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPL17-214ENST00000582588 401 ntTSL 23.14□□□□□ -1.914e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 215.22■□□□□ 0.036e-8■■□□□ 12.6
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