Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SORT1Q99523 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms