RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.4■■■■□ 3.42
HPS1-202ENST00000338546 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.7■■■□□ 2.67
HPS1-202ENST00000338546 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
HPS1-202ENST00000338546 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.21■■■□□ 2.43
HPS1-202ENST00000338546 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.82■■■□□ 2.36
HPS1-202ENST00000338546 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.81■■■□□ 2.36
HPS1-202ENST00000338546 ABCC9O60706 1549 aa29.62■■■□□ 2.33
HPS1-202ENST00000338546 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.61■■■□□ 2.33
HPS1-202ENST00000338546 NACADO15069 1562 aa29.49■■■□□ 2.31
HPS1-202ENST00000338546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.15■■■□□ 2.26
HPS1-202ENST00000338546 SCRIBQ14160 1630 aa29.01■■■□□ 2.24
HPS1-202ENST00000338546 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
HPS1-202ENST00000338546 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.48■■■□□ 2.15
HPS1-202ENST00000338546 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
HPS1-202ENST00000338546 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.21■■■□□ 2.11
HPS1-202ENST00000338546 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.17■■■□□ 2.1
HPS1-202ENST00000338546 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
HPS1-202ENST00000338546 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.06■■■□□ 2.08
HPS1-202ENST00000338546 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.94■■■□□ 2.06
HPS1-202ENST00000338546 SMARCA4P51532 1647 aa27.92■■■□□ 2.06
HPS1-202ENST00000338546 WIZO95785 1651 aa27.82■■■□□ 2.04
HPS1-202ENST00000338546 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.65■■■□□ 2.02
HPS1-202ENST00000338546 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.63■■■□□ 2.01
HPS1-202ENST00000338546 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
HPS1-202ENST00000338546 SMARCA2P51531 1590 aa27.46■■□□□ 1.99
HPS1-202ENST00000338546 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.42■■□□□ 1.98
HPS1-202ENST00000338546 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
HPS1-202ENST00000338546 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.31■■□□□ 1.96
HPS1-202ENST00000338546 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
HPS1-202ENST00000338546 NCAPD3P42695 1498 aa27.21■■□□□ 1.95
HPS1-202ENST00000338546 HMGXB3Q12766 1538 aa27.18■■□□□ 1.94
HPS1-202ENST00000338546 TRIM41Q8WV44 630 aa27.03■■□□□ 1.92
HPS1-202ENST00000338546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.87■■□□□ 1.89
HPS1-202ENST00000338546 ABCC8Q09428 1581 aa26.71■■□□□ 1.87
HPS1-202ENST00000338546 CFTRP13569 1480 aa26.63■■□□□ 1.85
HPS1-202ENST00000338546 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
HPS1-202ENST00000338546 PRDM2Q13029 1718 aa26.51■■□□□ 1.83
HPS1-202ENST00000338546 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.5■■□□□ 1.83
HPS1-202ENST00000338546 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.48■■□□□ 1.83
HPS1-202ENST00000338546 EEA1Q15075 1411 aa26.47■■□□□ 1.83
HPS1-202ENST00000338546 SYNJ1O43426 1573 aa26.45■■□□□ 1.82
HPS1-202ENST00000338546 TOP2BQ02880 1626 aa26.41■■□□□ 1.82
HPS1-202ENST00000338546 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
HPS1-202ENST00000338546 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.38■■□□□ 1.81
HPS1-202ENST00000338546 SOGA1O94964 1423 aa26.29■■□□□ 1.8
HPS1-202ENST00000338546 CUX1P39880 1505 aa26.23■■□□□ 1.79
HPS1-202ENST00000338546 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.23■■□□□ 1.79
HPS1-202ENST00000338546 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.2■■□□□ 1.79
HPS1-202ENST00000338546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.16■■□□□ 1.78
HPS1-202ENST00000338546 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.15■■□□□ 1.78
HPS1-202ENST00000338546 NESP48681 1621 aa26.05■■□□□ 1.76
HPS1-202ENST00000338546 KIF21BO75037 1637 aa26.04■■□□□ 1.76
HPS1-202ENST00000338546 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.03■■□□□ 1.76
HPS1-202ENST00000338546 GOLGA3Q08378 1498 aa26.02■■□□□ 1.76
HPS1-202ENST00000338546 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.02■■□□□ 1.76
HPS1-202ENST00000338546 TNIKQ9UKE5 1360 aa26■■□□□ 1.75
HPS1-202ENST00000338546 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26■■□□□ 1.75
HPS1-202ENST00000338546 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.99■■□□□ 1.75
HPS1-202ENST00000338546 KIF27Q86VH2 1401 aa25.97■■□□□ 1.75
HPS1-202ENST00000338546 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.92■■□□□ 1.74
HPS1-202ENST00000338546 TOPBP1Q92547 1522 aa25.9■■□□□ 1.74
HPS1-202ENST00000338546 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.9■■□□□ 1.74
HPS1-202ENST00000338546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.85■■□□□ 1.73
HPS1-202ENST00000338546 PRXQ9BXM0 1461 aa25.84■■□□□ 1.73
HPS1-202ENST00000338546 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HPS1-202ENST00000338546 CEP162Q5TB80 1403 aa25.8■■□□□ 1.72
HPS1-202ENST00000338546 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
HPS1-202ENST00000338546 CUX2O14529 1486 aa25.79■■□□□ 1.72
HPS1-202ENST00000338546 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HPS1-202ENST00000338546 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.78■■□□□ 1.72
HPS1-202ENST00000338546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.77■■□□□ 1.72
HPS1-202ENST00000338546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.76■■□□□ 1.71
HPS1-202ENST00000338546 IGF1RP08069 1367 aa25.7■■□□□ 1.71
HPS1-202ENST00000338546 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.65■■□□□ 1.7
HPS1-202ENST00000338546 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.65■■□□□ 1.7
HPS1-202ENST00000338546 WDR97A6NE52 1622 aa25.62■■□□□ 1.69
HPS1-202ENST00000338546 CLIP1P30622 1438 aa25.58■■□□□ 1.68
HPS1-202ENST00000338546 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HPS1-202ENST00000338546 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.57■■□□□ 1.68
HPS1-202ENST00000338546 WDR62O43379 1518 aa25.52■■□□□ 1.68
HPS1-202ENST00000338546 CUL7Q14999 1698 aa25.51■■□□□ 1.67
HPS1-202ENST00000338546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.51■■□□□ 1.67
HPS1-202ENST00000338546 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
HPS1-202ENST00000338546 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.49■■□□□ 1.67
HPS1-202ENST00000338546 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.44■■□□□ 1.66
HPS1-202ENST00000338546 ERCC6Q03468 1493 aa25.43■■□□□ 1.66
HPS1-202ENST00000338546 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.41■■□□□ 1.66
HPS1-202ENST00000338546 IFT140Q96RY7 1462 aa25.39■■□□□ 1.66
HPS1-202ENST00000338546 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
HPS1-202ENST00000338546 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HPS1-202ENST00000338546 ARAP1Q96P48 1450 aa25.28■■□□□ 1.64
HPS1-202ENST00000338546 PBRM1Q86U86 1689 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS1-202ENST00000338546 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS1-202ENST00000338546 GRIN2BQ13224 1484 aa25.24■■□□□ 1.63
HPS1-202ENST00000338546 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.21■■□□□ 1.63
HPS1-202ENST00000338546 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.2■■□□□ 1.63
HPS1-202ENST00000338546 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.627e-7■■■■■ 30.1
HPS1-202ENST00000338546 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HPS1-202ENST00000338546 APLP2Q06481 763 aa25.17■■□□□ 1.62
HPS1-202ENST00000338546 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.16■■□□□ 1.62
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