RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336425.9

TBXAS1-201, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TBXAS1, Length 2,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-201ENST00000336425 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.96■■■□□ 2.87
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TBXAS1-201ENST00000336425 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.83■■■□□ 2.05
TBXAS1-201ENST00000336425 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
TBXAS1-201ENST00000336425 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.19■■□□□ 1.94
TBXAS1-201ENST00000336425 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.89■■□□□ 1.9
TBXAS1-201ENST00000336425 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.72■■□□□ 1.87
TBXAS1-201ENST00000336425 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.68■■□□□ 1.86
TBXAS1-201ENST00000336425 ABCC9O60706 1549 aa26.4■■□□□ 1.82
TBXAS1-201ENST00000336425 SCRIBQ14160 1630 aa26.18■■□□□ 1.78
TBXAS1-201ENST00000336425 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
TBXAS1-201ENST00000336425 HRCP23327 699 aa26■■□□□ 1.75
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TBXAS1-201ENST00000336425 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.85■■□□□ 1.73
TBXAS1-201ENST00000336425 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.82■■□□□ 1.72
TBXAS1-201ENST00000336425 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.8■■□□□ 1.72
TBXAS1-201ENST00000336425 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.6■■□□□ 1.69
TBXAS1-201ENST00000336425 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.58■■□□□ 1.69
TBXAS1-201ENST00000336425 TRIM41Q8WV44 630 aa25.5■■□□□ 1.67
TBXAS1-201ENST00000336425 WIZO95785 1651 aa25.46■■□□□ 1.67
TBXAS1-201ENST00000336425 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
TBXAS1-201ENST00000336425 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TBXAS1-201ENST00000336425 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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TBXAS1-201ENST00000336425 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TBXAS1-201ENST00000336425 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.16■■□□□ 1.62
TBXAS1-201ENST00000336425 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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TBXAS1-201ENST00000336425 SMARCA2P51531 1590 aa24.98■■□□□ 1.59
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TBXAS1-201ENST00000336425 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.93■■□□□ 1.58
TBXAS1-201ENST00000336425 ABCC8Q09428 1581 aa24.85■■□□□ 1.57
TBXAS1-201ENST00000336425 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.83■■□□□ 1.57
TBXAS1-201ENST00000336425 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.78■■□□□ 1.56
TBXAS1-201ENST00000336425 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.72■■□□□ 1.55
TBXAS1-201ENST00000336425 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
TBXAS1-201ENST00000336425 EEA1Q15075 1411 aa24.64■■□□□ 1.53
TBXAS1-201ENST00000336425 SOGA1O94964 1423 aa24.59■■□□□ 1.53
TBXAS1-201ENST00000336425 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.55■■□□□ 1.52
TBXAS1-201ENST00000336425 CEP162Q5TB80 1403 aa24.55■■□□□ 1.52
TBXAS1-201ENST00000336425 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
TBXAS1-201ENST00000336425 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.47■■□□□ 1.51
TBXAS1-201ENST00000336425 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.44■■□□□ 1.5
TBXAS1-201ENST00000336425 GOLGA3Q08378 1498 aa24.41■■□□□ 1.5
TBXAS1-201ENST00000336425 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.4■■□□□ 1.5
TBXAS1-201ENST00000336425 SYNJ1O43426 1573 aa24.38■■□□□ 1.49
TBXAS1-201ENST00000336425 KIF21BO75037 1637 aa24.34■■□□□ 1.49
TBXAS1-201ENST00000336425 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TBXAS1-201ENST00000336425 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
TBXAS1-201ENST00000336425 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.28■■□□□ 1.48
TBXAS1-201ENST00000336425 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
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TBXAS1-201ENST00000336425 TOP2BQ02880 1626 aa24.13■■□□□ 1.45
TBXAS1-201ENST00000336425 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.1■■□□□ 1.45
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TBXAS1-201ENST00000336425 CLIP1P30622 1438 aa24.07■■□□□ 1.44
TBXAS1-201ENST00000336425 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.03■■□□□ 1.44
TBXAS1-201ENST00000336425 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.03■■□□□ 1.44
TBXAS1-201ENST00000336425 HMGXB3Q12766 1538 aa24.03■■□□□ 1.44
TBXAS1-201ENST00000336425 NCAPD3P42695 1498 aa23.95■■□□□ 1.42
TBXAS1-201ENST00000336425 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.94■■□□□ 1.42
TBXAS1-201ENST00000336425 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TBXAS1-201ENST00000336425 PRXQ9BXM0 1461 aa23.88■■□□□ 1.41
TBXAS1-201ENST00000336425 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TBXAS1-201ENST00000336425 CUX1P39880 1505 aa23.83■■□□□ 1.41
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TBXAS1-201ENST00000336425 ARAP1Q96P48 1450 aa23.75■■□□□ 1.39
TBXAS1-201ENST00000336425 APLP2Q06481 763 aa23.74■■□□□ 1.39
TBXAS1-201ENST00000336425 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
TBXAS1-201ENST00000336425 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
TBXAS1-201ENST00000336425 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TBXAS1-201ENST00000336425 KIF27Q86VH2 1401 aa23.7■■□□□ 1.38
TBXAS1-201ENST00000336425 NEUROD1Q13562 356 aa23.64■■□□□ 1.38
TBXAS1-201ENST00000336425 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TBXAS1-201ENST00000336425 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
TBXAS1-201ENST00000336425 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
TBXAS1-201ENST00000336425 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.52■■□□□ 1.36
TBXAS1-201ENST00000336425 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
TBXAS1-201ENST00000336425 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.51■■□□□ 1.35
TBXAS1-201ENST00000336425 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TBXAS1-201ENST00000336425 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
TBXAS1-201ENST00000336425 CUX2O14529 1486 aa23.44■■□□□ 1.34
TBXAS1-201ENST00000336425 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.43■■□□□ 1.34
TBXAS1-201ENST00000336425 IGF1RP08069 1367 aa23.41■■□□□ 1.34
TBXAS1-201ENST00000336425 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.38■■□□□ 1.33
TBXAS1-201ENST00000336425 MAP3K1Q13233 1512 aa23.37■■□□□ 1.33
TBXAS1-201ENST00000336425 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.36■■□□□ 1.33
TBXAS1-201ENST00000336425 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.36■■□□□ 1.33
TBXAS1-201ENST00000336425 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.33■■□□□ 1.33
TBXAS1-201ENST00000336425 TIAM1Q13009 1591 aa23.32■■□□□ 1.32
TBXAS1-201ENST00000336425 MIER1Q8N108 512 aa23.32■■□□□ 1.32
TBXAS1-201ENST00000336425 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.29■■□□□ 1.32
TBXAS1-201ENST00000336425 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.22■■□□□ 1.31
TBXAS1-201ENST00000336425 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.21■■□□□ 1.31
TBXAS1-201ENST00000336425 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.2■■□□□ 1.3
TBXAS1-201ENST00000336425 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.19■■□□□ 1.3
TBXAS1-201ENST00000336425 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.16■■□□□ 1.3
TBXAS1-201ENST00000336425 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
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