Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCO5AQ8N6Q1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCO5AQ8N6Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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