Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TMCO5AQ8N6Q1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TMCO5AQ8N6Q1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TMCO5AQ8N6Q1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMCO5AQ8N6Q1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TMCO5AQ8N6Q1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TMCO5AQ8N6Q1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMCO5AQ8N6Q1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TMCO5AQ8N6Q1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMCO5AQ8N6Q1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMCO5AQ8N6Q1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMCO5AQ8N6Q1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMCO5AQ8N6Q1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TMCO5AQ8N6Q1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMCO5AQ8N6Q1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMCO5AQ8N6Q1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMCO5AQ8N6Q1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TMCO5AQ8N6Q1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMCO5AQ8N6Q1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMCO5AQ8N6Q1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMCO5AQ8N6Q1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMCO5AQ8N6Q1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO5AQ8N6Q1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO5AQ8N6Q1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO5AQ8N6Q1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO5AQ8N6Q1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMCO5AQ8N6Q1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMCO5AQ8N6Q1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMCO5AQ8N6Q1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMCO5AQ8N6Q1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMCO5AQ8N6Q1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMCO5AQ8N6Q1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMCO5AQ8N6Q1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMCO5AQ8N6Q1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCO5AQ8N6Q1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMCO5AQ8N6Q1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMCO5AQ8N6Q1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMCO5AQ8N6Q1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMCO5AQ8N6Q1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMCO5AQ8N6Q1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMCO5AQ8N6Q1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMCO5AQ8N6Q1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMCO5AQ8N6Q1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMCO5AQ8N6Q1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMCO5AQ8N6Q1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMCO5AQ8N6Q1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO5AQ8N6Q1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMCO5AQ8N6Q1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMCO5AQ8N6Q1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMCO5AQ8N6Q1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO5AQ8N6Q1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMCO5AQ8N6Q1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMCO5AQ8N6Q1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMCO5AQ8N6Q1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMCO5AQ8N6Q1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMCO5AQ8N6Q1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMCO5AQ8N6Q1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMCO5AQ8N6Q1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCO5AQ8N6Q1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMCO5AQ8N6Q1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMCO5AQ8N6Q1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMCO5AQ8N6Q1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO5AQ8N6Q1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMCO5AQ8N6Q1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMCO5AQ8N6Q1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMCO5AQ8N6Q1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO5AQ8N6Q1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO5AQ8N6Q1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO5AQ8N6Q1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMCO5AQ8N6Q1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMCO5AQ8N6Q1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO5AQ8N6Q1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5AQ8N6Q1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO5AQ8N6Q1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO5AQ8N6Q1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO5AQ8N6Q1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO5AQ8N6Q1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO5AQ8N6Q1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMCO5AQ8N6Q1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO5AQ8N6Q1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO5AQ8N6Q1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO5AQ8N6Q1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCO5AQ8N6Q1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO5AQ8N6Q1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO5AQ8N6Q1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCO5AQ8N6Q1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO5AQ8N6Q1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO5AQ8N6Q1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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