Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SPATS2-217ENST00000550997 675 ntTSL 516.72■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-216ENST00000550643 527 ntTSL 416.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-213ENST00000549375 1061 ntTSL 215.49■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-207ENST00000548710 558 ntTSL 414.21□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-204ENST00000548377 552 ntTSL 49.05□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-206ENST00000548654 546 ntTSL 35.26□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-215ENST00000549538 570 ntTSL 44.01□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 PPM1F-209ENST00000497072 159 ntTSL 314.19□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 43.5
GTF2F1P35269 ACSF3-213ENST00000542688 2024 ntTSL 521■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 43.5
GTF2F1P35269 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 43.5
GTF2F1P35269 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 43.5
GTF2F1P35269 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 43.5
GTF2F1P35269 ACSF3-206ENST00000537116 2496 ntTSL 214.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 43.5
GTF2F1P35269 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 43.5
GTF2F1P35269 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 43.5
GTF2F1P35269 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 43.4
GTF2F1P35269 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 43.4
GTF2F1P35269 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 43.4
GTF2F1P35269 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 43.4
GTF2F1P35269 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 43.4
GTF2F1P35269 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 43.4
GTF2F1P35269 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 43.4
GTF2F1P35269 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 57.38□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 43.4
GTF2F1P35269 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 TEN1-CDK3-201ENST00000567351 3897 ntTSL 217.48■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 CDK3-204ENST00000588812 570 ntTSL 311.84□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-210ENST00000559036 685 ntTSL 228.34■■■□□ 2.139e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-208ENST00000558856 574 ntTSL 428.34■■■□□ 2.139e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-209ENST00000558983 847 ntTSL 328.07■■■□□ 2.089e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-212ENST00000560493 732 ntTSL 426.51■■□□□ 1.839e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.549e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.239e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 19e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-206ENST00000558049 565 ntTSL 415.5■□□□□ 0.079e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 USP54-201ENST00000339859 6247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.89e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.869e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.089e-8■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 BZW1-206ENST00000447069 557 ntTSL 411.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 43.3
GTF2F1P35269 AMFR-211ENST00000568657 539 ntTSL 425.2■■□□□ 1.623e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 AMFR-206ENST00000565445 803 ntTSL 523.96■■□□□ 1.433e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 220.73■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 AMFR-204ENST00000563664 567 ntTSL 410.67□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 314□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 317.37■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.485e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.444e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.394e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 43.2
GTF2F1P35269 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.937e-7■■■■■ 43.1
GTF2F1P35269 DHRS3-203ENST00000482265 1036 ntTSL 316.42■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 43.1
GTF2F1P35269 DHRS3-202ENST00000464917 539 ntTSL 315.14■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 43.1
GTF2F1P35269 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 416.21■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 43.1
GTF2F1P35269 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 43.1
GTF2F1P35269 ROR2-208ENST00000550066 4360 ntTSL 211.8□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 43.1
GTF2F1P35269 PTOV1-205ENST00000595934 1880 nt25.11■■□□□ 1.616e-12■■■■■ 43
GTF2F1P35269 PTOV1-207ENST00000596424 625 ntTSL 220.36■□□□□ 0.856e-12■■■■■ 43
GTF2F1P35269 MLH1-214ENST00000457004 668 ntTSL 315.7■□□□□ 0.19e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-221ENST00000536378 2567 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.519e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-201ENST00000231790 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.719e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-222ENST00000539477 2366 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.799e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.89e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-213ENST00000456676 2230 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.949e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-209ENST00000447829 608 ntTSL 1 (best)8.84□□□□□ -0.999e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-215ENST00000458009 660 ntTSL 1 (best)7.45□□□□□ -1.229e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-207ENST00000441265 917 ntTSL 57.37□□□□□ -1.239e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.279e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.629e-16■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.264e-10■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 LRRC75B-204ENST00000460524 2276 ntTSL 533.44■■■□□ 2.943e-11■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 LRRC75B-202ENST00000404045 1417 ntTSL 330.82■■■□□ 2.523e-11■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.513e-11■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 LRRC75B-206ENST00000465334 957 ntTSL 230.4■■■□□ 2.463e-11■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 LRRC75B-203ENST00000446942 1828 ntTSL 529.77■■■□□ 2.363e-11■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 LRRC75B-207ENST00000491910 2943 ntTSL 226.93■■□□□ 1.93e-11■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 LRRC75B-205ENST00000464490 575 ntTSL 418.45■□□□□ 0.543e-11■■■■■ 42.9
GTF2F1P35269 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.181e-11■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.481e-11■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-11■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 417.35■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 217.35■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 410.79□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.164e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 LRRC27-209ENST00000475747 2660 ntTSL 219.2■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 LRRC27-202ENST00000368612 1765 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 LRRC27-206ENST00000462656 2302 ntTSL 212.26□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 LRRC27-208ENST00000472556 646 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 42.8
GTF2F1P35269 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.552e-8■■■■■ 42.8
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 317.4 ms