RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558856.5

MEF2A-208, Transcript of myocyte enhancer factor 2A, humanhuman

TSL 4

Gene MEF2A, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEF2A-208ENST00000558856 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.89■■■■■ 7.66
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MEF2A-208ENST00000558856 ABCC9O60706 1549 aa55.34■■■■■ 6.45
MEF2A-208ENST00000558856 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.06■■■■■ 6.08
MEF2A-208ENST00000558856 NACADO15069 1562 aa52.88■■■■■ 6.06
MEF2A-208ENST00000558856 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.75■■■■■ 6.03
MEF2A-208ENST00000558856 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.41■■■■■ 5.98
MEF2A-208ENST00000558856 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.31■■■■■ 5.96
MEF2A-208ENST00000558856 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.02■■■■■ 5.92
MEF2A-208ENST00000558856 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.76■■■■■ 5.88
MEF2A-208ENST00000558856 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.63■■■■■ 5.86
MEF2A-208ENST00000558856 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.42■■■■■ 5.82
MEF2A-208ENST00000558856 SCRIBQ14160 1630 aa51.18■■■■■ 5.78
MEF2A-208ENST00000558856 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.14■■■■■ 5.78
MEF2A-208ENST00000558856 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.91■■■■■ 5.74
MEF2A-208ENST00000558856 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.13■■■■■ 5.62
MEF2A-208ENST00000558856 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.03■■■■■ 5.6
MEF2A-208ENST00000558856 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.79■■■■■ 5.56
MEF2A-208ENST00000558856 SMARCA4P51532 1647 aa48.91■■■■■ 5.42
MEF2A-208ENST00000558856 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.8■■■■■ 5.4
MEF2A-208ENST00000558856 NCAPD3P42695 1498 aa48.79■■■■■ 5.4
MEF2A-208ENST00000558856 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.74■■■■■ 5.39
MEF2A-208ENST00000558856 SMARCA2P51531 1590 aa48.69■■■■■ 5.39
MEF2A-208ENST00000558856 HMGXB3Q12766 1538 aa48.53■■■■■ 5.36
MEF2A-208ENST00000558856 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.45■■■■■ 5.35
MEF2A-208ENST00000558856 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.43■■■■■ 5.34
MEF2A-208ENST00000558856 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
MEF2A-208ENST00000558856 WIZO95785 1651 aa47.9■■■■■ 5.26
MEF2A-208ENST00000558856 ERCC6Q03468 1493 aa47.78■■■■■ 5.24
MEF2A-208ENST00000558856 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.74■■■■■ 5.23
MEF2A-208ENST00000558856 NESP48681 1621 aa47.74■■■■■ 5.23
MEF2A-208ENST00000558856 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.59■■■■■ 5.21
MEF2A-208ENST00000558856 CUX2O14529 1486 aa47.41■■■■■ 5.18
MEF2A-208ENST00000558856 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
MEF2A-208ENST00000558856 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.35■■■■■ 5.17
MEF2A-208ENST00000558856 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.3■■■■■ 5.16
MEF2A-208ENST00000558856 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.16■■■■■ 5.14
MEF2A-208ENST00000558856 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
MEF2A-208ENST00000558856 CFTRP13569 1480 aa46.97■■■■■ 5.11
MEF2A-208ENST00000558856 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.83■■■■■ 5.09
MEF2A-208ENST00000558856 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.82■■■■■ 5.09
MEF2A-208ENST00000558856 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.82■■■■■ 5.09
MEF2A-208ENST00000558856 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.82■■■■■ 5.09
MEF2A-208ENST00000558856 WDR62O43379 1518 aa46.69■■■■■ 5.06
MEF2A-208ENST00000558856 PRDM2Q13029 1718 aa46.55■■■■■ 5.04
MEF2A-208ENST00000558856 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.45■■■■■ 5.03
MEF2A-208ENST00000558856 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
MEF2A-208ENST00000558856 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
MEF2A-208ENST00000558856 TOPBP1Q92547 1522 aa46.01■■■■■ 4.96
MEF2A-208ENST00000558856 ABCC8Q09428 1581 aa46.01■■■■■ 4.96
MEF2A-208ENST00000558856 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.93■■■■■ 4.94
MEF2A-208ENST00000558856 IFT140Q96RY7 1462 aa45.85■■■■■ 4.93
MEF2A-208ENST00000558856 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
MEF2A-208ENST00000558856 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
MEF2A-208ENST00000558856 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
MEF2A-208ENST00000558856 CUX1P39880 1505 aa45.49■■■■■ 4.87
MEF2A-208ENST00000558856 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
MEF2A-208ENST00000558856 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.42■■■■■ 4.86
MEF2A-208ENST00000558856 SOGA1O94964 1423 aa45.4■■■■■ 4.86
MEF2A-208ENST00000558856 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.39■■■■■ 4.86
MEF2A-208ENST00000558856 OSCARQ8IYS5 282 aa45.36■■■■■ 4.85
MEF2A-208ENST00000558856 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.34■■■■■ 4.85
MEF2A-208ENST00000558856 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
MEF2A-208ENST00000558856 WDR97A6NE52 1622 aa45.18■■■■■ 4.82
MEF2A-208ENST00000558856 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.05■■■■■ 4.8
MEF2A-208ENST00000558856 TOP2BQ02880 1626 aa44.99■■■■■ 4.79
MEF2A-208ENST00000558856 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.97■■■■■ 4.79
MEF2A-208ENST00000558856 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.96■■■■■ 4.79
MEF2A-208ENST00000558856 CHD1O14646 1710 aa44.95■■■■■ 4.79
MEF2A-208ENST00000558856 SYNJ1O43426 1573 aa44.94■■■■■ 4.79
MEF2A-208ENST00000558856 GRIN2BQ13224 1484 aa44.94■■■■■ 4.78
MEF2A-208ENST00000558856 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.94■■■■■ 4.78
MEF2A-208ENST00000558856 FBLN2P98095 1184 aa44.92■■■■■ 4.78
MEF2A-208ENST00000558856 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.88■■■■■ 4.78
MEF2A-208ENST00000558856 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
MEF2A-208ENST00000558856 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.81■■■■■ 4.76
MEF2A-208ENST00000558856 PBRM1Q86U86 1689 aa44.78■■■■■ 4.76
MEF2A-208ENST00000558856 TRIM41Q8WV44 630 aa44.76■■■■■ 4.76
MEF2A-208ENST00000558856 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
MEF2A-208ENST00000558856 SYNJ2O15056 1496 aa44.7■■■■■ 4.75
MEF2A-208ENST00000558856 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.67■■■■■ 4.74
MEF2A-208ENST00000558856 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.67■■■■■ 4.74
MEF2A-208ENST00000558856 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.67■■■■■ 4.74
MEF2A-208ENST00000558856 ARHGEF11O15085 1522 aa44.62■■■■■ 4.73
MEF2A-208ENST00000558856 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.48■■■■■ 4.71
MEF2A-208ENST00000558856 ADAMTS12P58397 1594 aa44.43■■■■■ 4.7
MEF2A-208ENST00000558856 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.42■■■■■ 4.7
MEF2A-208ENST00000558856 GRIN2AQ12879 1464 aa44.35■■■■■ 4.69
MEF2A-208ENST00000558856 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.34■■■■■ 4.69
MEF2A-208ENST00000558856 ARAP1Q96P48 1450 aa44.23■■■■■ 4.67
MEF2A-208ENST00000558856 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.23■■■■■ 4.67
MEF2A-208ENST00000558856 NUP160Q12769 1436 aa44.16■■■■■ 4.66
MEF2A-208ENST00000558856 KIF27Q86VH2 1401 aa44.16■■■■■ 4.66
MEF2A-208ENST00000558856 CEP170Q5SW79 1584 aa44.14■■■■■ 4.66
MEF2A-208ENST00000558856 IGF1RP08069 1367 aa43.99■■■■■ 4.63
MEF2A-208ENST00000558856 CUL7Q14999 1698 aa43.94■■■■■ 4.62
MEF2A-208ENST00000558856 SHROOM2Q13796 1616 aa43.87■■■■■ 4.61
MEF2A-208ENST00000558856 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.81■■■■■ 4.6
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MEF2A-208ENST00000558856 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.75■■■■■ 4.59
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