RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560493.5

MEF2A-212, Transcript of myocyte enhancer factor 2A, humanhuman

TSL 4

Gene MEF2A, Length 732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEF2A-212ENST00000560493 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.64■■■■■ 6.98
MEF2A-212ENST00000560493 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.29■■■■■ 5.96
MEF2A-212ENST00000560493 ABCC9O60706 1549 aa51.96■■■■■ 5.91
MEF2A-212ENST00000560493 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.62■■■■■ 5.53
MEF2A-212ENST00000560493 NACADO15069 1562 aa49.42■■■■■ 5.5
MEF2A-212ENST00000560493 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.37■■■■■ 5.49
MEF2A-212ENST00000560493 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.93■■■■■ 5.42
MEF2A-212ENST00000560493 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
MEF2A-212ENST00000560493 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.53■■■■■ 5.36
MEF2A-212ENST00000560493 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.47■■■■■ 5.35
MEF2A-212ENST00000560493 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.43■■■■■ 5.34
MEF2A-212ENST00000560493 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.35■■■■■ 5.33
MEF2A-212ENST00000560493 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.17■■■■■ 5.3
MEF2A-212ENST00000560493 SCRIBQ14160 1630 aa47.71■■■■■ 5.23
MEF2A-212ENST00000560493 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.59■■■■■ 5.21
MEF2A-212ENST00000560493 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
MEF2A-212ENST00000560493 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.91■■■■■ 5.1
MEF2A-212ENST00000560493 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.77■■■■■ 5.08
MEF2A-212ENST00000560493 NCAPD3P42695 1498 aa45.69■■■■■ 4.91
MEF2A-212ENST00000560493 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.6■■■■■ 4.89
MEF2A-212ENST00000560493 SMARCA4P51532 1647 aa45.58■■■■■ 4.89
MEF2A-212ENST00000560493 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
MEF2A-212ENST00000560493 SMARCA2P51531 1590 aa45.45■■■■■ 4.87
MEF2A-212ENST00000560493 HMGXB3Q12766 1538 aa45.31■■■■■ 4.84
MEF2A-212ENST00000560493 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.19■■■■■ 4.82
MEF2A-212ENST00000560493 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.17■■■■■ 4.82
MEF2A-212ENST00000560493 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
MEF2A-212ENST00000560493 ERCC6Q03468 1493 aa44.82■■■■■ 4.77
MEF2A-212ENST00000560493 NESP48681 1621 aa44.77■■■■■ 4.76
MEF2A-212ENST00000560493 WIZO95785 1651 aa44.6■■■■■ 4.73
MEF2A-212ENST00000560493 CUX2O14529 1486 aa44.59■■■■■ 4.73
MEF2A-212ENST00000560493 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.5■■■■■ 4.71
MEF2A-212ENST00000560493 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
MEF2A-212ENST00000560493 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.34■■■■■ 4.69
MEF2A-212ENST00000560493 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.3■■■■■ 4.68
MEF2A-212ENST00000560493 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
MEF2A-212ENST00000560493 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.13■■■■■ 4.66
MEF2A-212ENST00000560493 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
MEF2A-212ENST00000560493 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.08■■■■■ 4.65
MEF2A-212ENST00000560493 CFTRP13569 1480 aa43.9■■■■■ 4.62
MEF2A-212ENST00000560493 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.85■■■■■ 4.61
MEF2A-212ENST00000560493 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.78■■■■■ 4.6
MEF2A-212ENST00000560493 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.76■■■■■ 4.6
MEF2A-212ENST00000560493 WDR62O43379 1518 aa43.7■■■■■ 4.59
MEF2A-212ENST00000560493 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.66■■■■■ 4.58
MEF2A-212ENST00000560493 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
MEF2A-212ENST00000560493 PRDM2Q13029 1718 aa43.26■■■■■ 4.52
MEF2A-212ENST00000560493 TOPBP1Q92547 1522 aa42.99■■■■■ 4.47
MEF2A-212ENST00000560493 ABCC8Q09428 1581 aa42.95■■■■■ 4.47
MEF2A-212ENST00000560493 IFT140Q96RY7 1462 aa42.9■■■■■ 4.46
MEF2A-212ENST00000560493 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
MEF2A-212ENST00000560493 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.84■■■■■ 4.45
MEF2A-212ENST00000560493 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
MEF2A-212ENST00000560493 OSCARQ8IYS5 282 aa42.73■■■■■ 4.43
MEF2A-212ENST00000560493 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
MEF2A-212ENST00000560493 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
MEF2A-212ENST00000560493 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.48■■■■■ 4.39
MEF2A-212ENST00000560493 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
MEF2A-212ENST00000560493 SOGA1O94964 1423 aa42.45■■■■■ 4.39
MEF2A-212ENST00000560493 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.44■■■■■ 4.38
MEF2A-212ENST00000560493 CUX1P39880 1505 aa42.41■■■■■ 4.38
MEF2A-212ENST00000560493 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.38■■■■■ 4.38
MEF2A-212ENST00000560493 TRIM41Q8WV44 630 aa42.35■■■■■ 4.37
MEF2A-212ENST00000560493 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
MEF2A-212ENST00000560493 WDR97A6NE52 1622 aa42.13■■■■■ 4.33
MEF2A-212ENST00000560493 FBLN2P98095 1184 aa42.12■■■■■ 4.33
MEF2A-212ENST00000560493 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.02■■■■■ 4.32
MEF2A-212ENST00000560493 CHD1O14646 1710 aa42.01■■■■■ 4.32
MEF2A-212ENST00000560493 GRIN2BQ13224 1484 aa42■■■■■ 4.31
MEF2A-212ENST00000560493 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.97■■■■■ 4.31
MEF2A-212ENST00000560493 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.97■■■■■ 4.31
MEF2A-212ENST00000560493 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.97■■■■■ 4.31
MEF2A-212ENST00000560493 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.95■■■■■ 4.31
MEF2A-212ENST00000560493 ARHGEF11O15085 1522 aa41.94■■■■■ 4.3
MEF2A-212ENST00000560493 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
MEF2A-212ENST00000560493 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
MEF2A-212ENST00000560493 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.92■■■■■ 4.3
MEF2A-212ENST00000560493 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
MEF2A-212ENST00000560493 TOP2BQ02880 1626 aa41.83■■■■■ 4.29
MEF2A-212ENST00000560493 SYNJ2O15056 1496 aa41.79■■■■■ 4.28
MEF2A-212ENST00000560493 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.79■■■■■ 4.28
MEF2A-212ENST00000560493 SYNJ1O43426 1573 aa41.79■■■■■ 4.28
MEF2A-212ENST00000560493 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.77■■■■■ 4.28
MEF2A-212ENST00000560493 PBRM1Q86U86 1689 aa41.71■■■■■ 4.27
MEF2A-212ENST00000560493 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.69■■■■■ 4.26
MEF2A-212ENST00000560493 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.65■■■■■ 4.26
MEF2A-212ENST00000560493 ARAP1Q96P48 1450 aa41.57■■■■■ 4.25
MEF2A-212ENST00000560493 GRIN2AQ12879 1464 aa41.44■■■■■ 4.22
MEF2A-212ENST00000560493 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.42■■■■■ 4.22
MEF2A-212ENST00000560493 ADAMTS12P58397 1594 aa41.42■■■■■ 4.22
MEF2A-212ENST00000560493 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.41■■■■■ 4.22
MEF2A-212ENST00000560493 NUP160Q12769 1436 aa41.32■■■■■ 4.21
MEF2A-212ENST00000560493 CEP170Q5SW79 1584 aa41.23■■■■■ 4.19
MEF2A-212ENST00000560493 KIF27Q86VH2 1401 aa41.1■■■■■ 4.17
MEF2A-212ENST00000560493 IGF1RP08069 1367 aa41.08■■■■■ 4.17
MEF2A-212ENST00000560493 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
MEF2A-212ENST00000560493 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.04■■■■■ 4.16
MEF2A-212ENST00000560493 SHROOM2Q13796 1616 aa40.99■■■■■ 4.15
MEF2A-212ENST00000560493 JPH4Q96JJ6 628 aa40.95■■■■■ 4.15
MEF2A-212ENST00000560493 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms