RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558983.5

MEF2A-209, Transcript of myocyte enhancer factor 2A, humanhuman

TSL 3

Gene MEF2A, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEF2A-209ENST00000558983 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.43■■■■■ 7.58
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MEF2A-209ENST00000558983 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.47■■■■■ 5.99
MEF2A-209ENST00000558983 NACADO15069 1562 aa52.34■■■■■ 5.97
MEF2A-209ENST00000558983 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.22■■■■■ 5.95
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MEF2A-209ENST00000558983 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.64■■■■■ 5.86
MEF2A-209ENST00000558983 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.33■■■■■ 5.81
MEF2A-209ENST00000558983 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.94■■■■■ 5.75
MEF2A-209ENST00000558983 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.85■■■■■ 5.73
MEF2A-209ENST00000558983 SCRIBQ14160 1630 aa50.76■■■■■ 5.72
MEF2A-209ENST00000558983 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.32■■■■■ 5.65
MEF2A-209ENST00000558983 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.19■■■■■ 5.63
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MEF2A-209ENST00000558983 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.4■■■■■ 5.5
MEF2A-209ENST00000558983 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.07■■■■■ 5.45
MEF2A-209ENST00000558983 SMARCA4P51532 1647 aa48.53■■■■■ 5.36
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MEF2A-209ENST00000558983 NCAPD3P42695 1498 aa48.25■■■■■ 5.31
MEF2A-209ENST00000558983 SMARCA2P51531 1590 aa48.24■■■■■ 5.31
MEF2A-209ENST00000558983 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.11■■■■■ 5.29
MEF2A-209ENST00000558983 HMGXB3Q12766 1538 aa48.05■■■■■ 5.28
MEF2A-209ENST00000558983 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.03■■■■■ 5.28
MEF2A-209ENST00000558983 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
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MEF2A-209ENST00000558983 NESP48681 1621 aa47.17■■■■■ 5.14
MEF2A-209ENST00000558983 ERCC6Q03468 1493 aa47.1■■■■■ 5.13
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MEF2A-209ENST00000558983 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.07■■■■■ 5.13
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MEF2A-209ENST00000558983 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.73■■■■■ 5.07
MEF2A-209ENST00000558983 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.7■■■■■ 5.07
MEF2A-209ENST00000558983 CUX2O14529 1486 aa46.65■■■■■ 5.06
MEF2A-209ENST00000558983 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
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MEF2A-209ENST00000558983 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.51■■■■■ 5.04
MEF2A-209ENST00000558983 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.33■■■■■ 5.01
MEF2A-209ENST00000558983 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.31■■■■■ 5
MEF2A-209ENST00000558983 PRDM2Q13029 1718 aa46.3■■■■■ 5
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MEF2A-209ENST00000558983 WDR62O43379 1518 aa46.14■■■■■ 4.98
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MEF2A-209ENST00000558983 TOPBP1Q92547 1522 aa45.57■■■■■ 4.89
MEF2A-209ENST00000558983 ABCC8Q09428 1581 aa45.57■■■■■ 4.89
MEF2A-209ENST00000558983 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.53■■■■■ 4.88
MEF2A-209ENST00000558983 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.38■■■■■ 4.86
MEF2A-209ENST00000558983 IFT140Q96RY7 1462 aa45.34■■■■■ 4.85
MEF2A-209ENST00000558983 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
MEF2A-209ENST00000558983 CUX1P39880 1505 aa45.16■■■■■ 4.82
MEF2A-209ENST00000558983 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
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MEF2A-209ENST00000558983 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.04■■■■■ 4.8
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MEF2A-209ENST00000558983 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.78■■■■■ 4.76
MEF2A-209ENST00000558983 WDR97A6NE52 1622 aa44.77■■■■■ 4.76
MEF2A-209ENST00000558983 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.76■■■■■ 4.76
MEF2A-209ENST00000558983 TOP2BQ02880 1626 aa44.74■■■■■ 4.75
MEF2A-209ENST00000558983 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
MEF2A-209ENST00000558983 SYNJ1O43426 1573 aa44.72■■■■■ 4.75
MEF2A-209ENST00000558983 OSCARQ8IYS5 282 aa44.64■■■■■ 4.74
MEF2A-209ENST00000558983 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.59■■■■■ 4.73
MEF2A-209ENST00000558983 CHD1O14646 1710 aa44.51■■■■■ 4.72
MEF2A-209ENST00000558983 GRIN2BQ13224 1484 aa44.48■■■■■ 4.71
MEF2A-209ENST00000558983 PBRM1Q86U86 1689 aa44.47■■■■■ 4.71
MEF2A-209ENST00000558983 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.47■■■■■ 4.71
MEF2A-209ENST00000558983 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.46■■■■■ 4.71
MEF2A-209ENST00000558983 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.46■■■■■ 4.71
MEF2A-209ENST00000558983 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
MEF2A-209ENST00000558983 FBLN2P98095 1184 aa44.36■■■■■ 4.69
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MEF2A-209ENST00000558983 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
MEF2A-209ENST00000558983 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.07■■■■■ 4.65
MEF2A-209ENST00000558983 ADAMTS12P58397 1594 aa44.06■■■■■ 4.64
MEF2A-209ENST00000558983 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
MEF2A-209ENST00000558983 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
MEF2A-209ENST00000558983 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
MEF2A-209ENST00000558983 ARHGEF11O15085 1522 aa43.97■■■■■ 4.63
MEF2A-209ENST00000558983 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.96■■■■■ 4.63
MEF2A-209ENST00000558983 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.93■■■■■ 4.62
MEF2A-209ENST00000558983 GRIN2AQ12879 1464 aa43.91■■■■■ 4.62
MEF2A-209ENST00000558983 KIF27Q86VH2 1401 aa43.88■■■■■ 4.61
MEF2A-209ENST00000558983 TRIM41Q8WV44 630 aa43.86■■■■■ 4.61
MEF2A-209ENST00000558983 CEP170Q5SW79 1584 aa43.72■■■■■ 4.59
MEF2A-209ENST00000558983 NUP160Q12769 1436 aa43.71■■■■■ 4.59
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MEF2A-209ENST00000558983 ARAP1Q96P48 1450 aa43.59■■■■■ 4.57
MEF2A-209ENST00000558983 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.53■■■■■ 4.56
MEF2A-209ENST00000558983 SHROOM2Q13796 1616 aa43.44■■■■■ 4.55
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MEF2A-209ENST00000558983 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.33■■■■■ 4.53
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