Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRGAP2BP0DMP2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2BP0DMP2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2BP0DMP2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2BP0DMP2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms