Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP2Q13309 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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