Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-7■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ARHGEF1-221ENST00000600387 2272 ntTSL 318.57■□□□□ 0.566e-9■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ARHGEF1-214ENST00000596957 570 ntTSL 315.21■□□□□ 0.036e-9■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-8■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.334e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.054e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.94e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.894e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.854e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.794e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.714e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.684e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-205ENST00000585553 2241 ntTSL 219.15■□□□□ 0.664e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 ACBD4-213ENST00000591136 862 ntTSL 312.65□□□□□ -0.384e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 POR-217ENST00000460892 603 ntTSL 213.61□□□□□ -0.235e-13■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 TELO2-202ENST00000497339 1667 ntTSL 520.99■□□□□ 0.951e-7■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-7■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 WNK4-204ENST00000591448 3909 ntTSL 1 (best)12.88□□□□□ -0.352e-7■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-7■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 NEK6-210ENST00000447379 716 ntTSL 516.64■□□□□ 0.251e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 MARCH6-211ENST00000512449 832 ntTSL 516.08■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 NEK6-206ENST00000422297 799 ntTSL 313.9□□□□□ -0.181e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 NEK6-202ENST00000373596 758 ntTSL 312.96□□□□□ -0.331e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 NEK6-207ENST00000423785 726 ntTSL 512.26□□□□□ -0.451e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 NEK6-208ENST00000425237 806 ntTSL 311.67□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 13.7
RBM22Q9NW64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.825e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.545e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.525e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDIA5-207ENST00000489923 1651 ntTSL 1 (best)23.49■■□□□ 1.355e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 CNEP1R1-209ENST00000567712 455 ntTSL 422.69■■□□□ 1.225e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.145e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 AKT1-217ENST00000557494 408 ntTSL 222.08■■□□□ 1.135e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.075e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SPRED1-202ENST00000561205 1177 ntTSL 521.59■■□□□ 1.055e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 CNEP1R1-201ENST00000389134 579 ntTSL 320.95■□□□□ 0.945e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SKA3-205ENST00000465471 930 ntTSL 520.53■□□□□ 0.885e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 KYAT1-206ENST00000451800 847 ntTSL 520.51■□□□□ 0.875e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 IPO7-202ENST00000527431 607 ntTSL 420.43■□□□□ 0.865e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDPK1-215ENST00000566659 451 ntTSL 320.37■□□□□ 0.855e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDPK1-207ENST00000462923 550 ntTSL 520.37■□□□□ 0.855e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.775e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.755e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDPK1-213ENST00000492021 552 ntTSL 519.6■□□□□ 0.735e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-209ENST00000471375 928 ntTSL 519.53■□□□□ 0.725e-11■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 KMT2E-211ENST00000480368 679 ntTSL 519.53■□□□□ 0.721e-8■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.685e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-218ENST00000496909 732 ntTSL 319.05■□□□□ 0.645e-11■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-207ENST00000470378 1034 ntTSL 319.02■□□□□ 0.645e-11■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 RMI1-202ENST00000445877 1553 ntTSL 1 (best)18.99■□□□□ 0.635e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 STX18-AS1-203ENST00000507244 669 ntTSL 218.74■□□□□ 0.595e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.535e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SLC25A17-211ENST00000443810 593 ntTSL 318.16■□□□□ 0.55e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SLC25A17-203ENST00000412879 561 ntTSL 418■□□□□ 0.475e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.475e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.435e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.415e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.355e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SLC25A17-214ENST00000458600 801 ntTSL 317.19■□□□□ 0.345e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 STX18-AS1-204ENST00000512438 549 ntTSL 317.11■□□□□ 0.335e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.335e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 STX18-AS1-202ENST00000502693 724 ntTSL 316.91■□□□□ 0.35e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 CNEP1R1-210ENST00000568890 1992 ntTSL 1 (best)16.88■□□□□ 0.295e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 AHCTF1-205ENST00000478568 611 ntTSL 416.86■□□□□ 0.295e-11■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 HDAC10-211ENST00000476310 847 ntTSL 316.83■□□□□ 0.285e-11■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.275e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 NUP58-212ENST00000481980 605 ntTSL 316.57■□□□□ 0.245e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.225e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.215e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SERINC2-203ENST00000487207 735 ntTSL 216.39■□□□□ 0.215e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.195e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.15e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 515.69■□□□□ 0.15e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 NUP58-211ENST00000480187 588 ntTSL 215.56■□□□□ 0.085e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 NUP58-213ENST00000490231 563 ntTSL 415.56■□□□□ 0.085e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.075e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SKA3-204ENST00000462482 750 ntTSL 215.3■□□□□ 0.045e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDPK1-217ENST00000570136 1125 ntTSL 215.14■□□□□ 0.015e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.015e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.015e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 IGF1R-210ENST00000559925 2280 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.021e-8■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PNPT1-206ENST00000481066 1281 ntTSL 514.85□□□□□ -0.035e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.045e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.055e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PSME1-207ENST00000560420 922 ntTSL 214.73□□□□□ -0.055e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.085e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.115e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 NUP58-205ENST00000460326 582 ntTSL 214.2□□□□□ -0.145e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.145e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.165e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 314.03□□□□□ -0.165e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.185e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.185e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 NUP58-207ENST00000465068 551 ntTSL 413.8□□□□□ -0.25e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.225e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.245e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.265e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 GYG2-206ENST00000453106 1158 ntTSL 213.39□□□□□ -0.275e-6■■□□□ 13.6
RBM22Q9NW64 SEC62-203ENST00000461933 363 ntTSL 213.39□□□□□ -0.275e-6■■□□□ 13.6
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